患病个体的序列扩增实验一基本方案2 基因组 DNA 的扩增
实验二
热休克蛋白
HSP90
的
PCR
扩增技术
一、
实验目的与原理简介
聚合酶链式反应(
polymerasechainreaction
)是体外克隆基因的重要方
法,
它可在几个小时内使模板分子扩增百万倍以上。
因此能用于从微量样品中获
得目的基因,
同时完成了基因在体外的克隆,
是分子生物学及基因工程中极为有
用的研究手段。
常规
PCR
用于已知
DNA
序列的扩增,具体可分为三个主要过程:
一、
变性
。
通过升高温度使
DNA
双链模板分子中氢断裂,
形成单链
DNA
分子,
温度为
94
℃,时间
1min
。
二、
复性
。降低温度使
DNA
单链分子同引物结合。温度为
55
℃,时间
1min
。
三、
延伸
。
升高温度,
在
DNA
聚合酶最佳活性的条件下在引物
3
端加入
dNTP
,
实现模板的扩增,温度为
72
℃,时间
2min
。同时第一步变性前要在
94
℃下
预变性
5
分钟,使
DNA
双链完全解开。经过
25-35
个循环之后,在
72
℃下
继续延伸
10
分钟。
PCR
反应包含的七种基本成分:
1
)热稳定性
DNA
聚合酶:
TaqDNA
聚合酶是最常适用的酶,商品化
TaqDNA
酶的特异性活性约为
80000
单位
/mg.
2
)寡核苷酸引物:
寡核苷酸引物的设计是影响
PCR
扩增反应的效率与特异性
的关键因素。
3
)脱氧核苷三磷酸(
dNTP
)
:标准的
PCR
反应体系应包括
4
种等摩尔浓度的
脱氧核苷三磷酸,即
dATP
、
dTTP
、
dCTP
和
dGTP
。每种
dNTP
的浓度一般在
200-250
μ
l
之间,高浓度的
dNTP
对扩增反应会起抑制作用,可能是
dNTP
与
Mg
2+
螯合有关。
4
)二价阳离子:
一般需要
Mg
2+
来激活热稳定的
DNA
聚合酶,
由于
dNTP
与寡聚
核酸结
Mg
2+
合,
因而反应体系中阳离子的浓度一般要超过
dNTP
和引物来源
的磷酸盐基团的摩尔浓度。
Mg
2+
的最佳浓度为
1.5mmol/L
。
5
)维持
PH
值的缓冲液:
用
Tris-Cl
在室温将
PCR
缓冲液的
PH
值调至
8.3-8.8
之间,标准
PCR
缓冲液浓度在
10mmol/L
。在
72
℃温育时,反应体系的温
度将下降
1
个多单位,致使缓冲液的
PH
值接近
7.2
。
6
)模板
DNA
:含有靶序列的模板
DNA
可以以单链或双链形式加入到
PCR
混合
液中,闭环
DNA
的及增效率略低于线性
DNA
。
实验目的:学习
PCR
反应的基本原理和基本技术。
二
、材料和试剂
10
Х
扩增缓冲液
4
种
dNTP
贮存液(
20mmol/L
,
PH8.0
)
TapDNA
聚合酶
5
端引物(
20
μ
mol/L
)及
3
端引物(
20
μ
mol/L
)
模板
DNA
琼脂糖凝胶
移液枪(
0.5-10
μ
L5-50
μ
L
)
枪头
实验操作
1
)
将
各成分加到微量离子管内混合:
1
0
Х
扩
增
缓
冲
液
2.
5
μ
l
5
端
引
物
1.
5
μ
l
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