2021-07-29【原创】腺病毒基因克隆，细菌电转吃大亏

最近在做腺病毒基因克隆，吃了大亏，长了见识。

我总共要做6个克隆。先把6个基因的CDNA克隆到shuttle质粒pAdTrack-CMV，进展很顺利。然后用PmeI处理重组shuttle质粒，过夜酶切，也很顺利。但与腺病毒backbone质粒pAdEasy-1共转化时遇到了大麻烦。起初，我没有BJ5183Ecoli菌株，就想当然像拿DH5a替代，但一直不成功。无论CaCl2法和电转法都不行，挑出来的克隆不是只含重组shuttle质粒，就是同时含有两种质粒，即重组shuttle质粒和pAdEasy-1。但各是各的，二者并没有在细菌内发生同源重组。

于是我借了BJ5183Ecoli菌株，采用电转化法，这时总算有点成功。6个重组腺病毒质粒构建成功了4个。经酶切鉴定均这4个克隆均正确。但是，另外2个总是失败，原因不详。于是我就重复重复，期间，糟糕的事情发生了....电转杯总是被击破，Bio-Rad电转仪总是出现"检测到低压故障电弧”的字样。想来想去找不到好的对策。起初我以为是有气泡，于是在做电转时尽可能避免气泡的出现。遗憾的是，这毫无帮助，电转杯还是击一个破一个。我那个心疼呀。倒不是心疼杯子，心疼的是我的细菌、质粒，用Tip又吸不出来，所以只好把它们丢掉。

Finally，我发现了其中的问题。我改用去离子水来溶解重组shuttle质粒和pAdEasy-1时电转杯就再也不破了。我分析，原因可能与电转菌液的离子强度有关。当我放较大体积（>15ul）的质粒到BJ5183Ecoli菌（20ul）中时，里面的TE缓冲液可能导致电击时产生高强度电流，结果杯子就破了。由此看来，气泡本身对电击可能不无影响，反而会减弱电流强度。但离子强度就不同了，离子强度太高，足以导致一次实验报废。

后感：失败并不可怕，可怕的是想当然去重复，而不去探究失败的原因。朋友们，如在这方面好的经历坏的经历，尽可拿出来一起分享。

让我们一起成长。