克隆基因

在质粒载体中进行平末端片段的克隆

在质粒载体中进行平末端片段的克隆

1.分别设立两个反应,用适当的限制性内切核酸酶消化1~10μg质粒DNA和外源DNA片段,使它们能产生平末端。

2.苯酚:氯仿抽提与乙醇沉淀法纯化出已被消化的载体和外源DNA片段。

3.分别用TEpH8.0)重新溶解纯化出的两种DNA沉淀,使终浓度为100ng/ml假设1bp相当于660Da,计算DNA的终浓度(pmol/ml)。

4.将载体DNA去磷酸化。

5.按下表将适量的DNA转移至无菌的0.5ml离心管:

管号

DNA

AE

载体1[60fmol(~100ng)]

B

外源插入片段2[60fmol(~10ng)]

CF

载体160fmol)和外源插入片段360fmol

D

线状载体(5’-磷酸化)(60fmol

G

环状载体[60fmol(~10ng)]

1载体DNA已进行去磷酸化

2外源目的DNA可以连接接头。

3连接反应中,质粒载体和插入的DNA片段摩尔比一般为11DNA的总浓度应约为10ng/μl

a.ABC管中加入:

10×连接缓冲液1.0μl

T4噬菌体连接酶0.5Weiss单位

5mmol/LATP1.0μl

H2O补至8.5μl

30%PEG80001~1.5μl

b.DEF管中加入:

10×连接缓冲液1.0μl

5mmol/LATP1.0μl

H2O补至8.5μl

30%PEG80001~1.5μl

不加DNA

6.连接反应体系置于16℃水浴温育过夜或20℃水浴温育4h

7.用每份稀释的连接产物转化感受态大肠杆菌。转化时,应包括用标准方法制备的已知量的超螺旋质粒DNA作为对照,以检查转化效率。

管号

DNA

连接酶(有/无)

预期转化克隆数

A

载体1

+

~03

B

插入片段

+

0

C

载体1和插入片段

+

F管高5

D

载体1

-

~0

E

载体2

-

D管高50

F

载体和插入片段

-

D管高50

G

环状质粒

-

2×105

1去磷酸化

2未去磷酸化

3如果出现来自去磷酸化的载体DNA自身连接产物的转化子,是由于用碱性磷酸酶处理时未能除尽5’端的磷酸基。

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