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在质粒载体中进行平末端片段的克隆
在质粒载体中进行平末端片段的克隆 1.分别设立两个反应,用适当的限制性内切核酸酶消化1~10μg质粒DNA和外源DNA片段,使它们能产生平末端。 2.苯酚:氯仿抽提与乙醇沉淀法纯化出已被消化的载体和外源DNA片段。 3.分别用TE(pH8.0)重新溶解纯化出的两种DNA沉淀,使终浓度为100ng/ml。假设1bp相当于660Da,计算DNA的终浓度(pmol/ml)。 4.将载体DNA去磷酸化。 5.按下表将适量的DNA转移至无菌的0.5ml离心管: 管号 DNA A和E 载体1[60fmol(~100ng)] B 外源插入片段2[60fmol(~10ng)] C和F 载体1(60fmol)和外源插入片段3(60fmol) D 线状载体(5’-磷酸化)(60fmol) G 环状载体[60fmol(~10ng)] 1载体DNA已进行去磷酸化 2外源目的DNA可以连接接头。 3连接反应中,质粒载体和插入的DNA片段摩尔比一般为1:1。DNA的总浓度应约为10ng/μl。 a.A、B和C管中加入: T4噬菌体连接酶0.5Weiss单位 5mmol/LATP1.0μl H2O补至8.5μl 30%PEG80001~1.5μl b.D、E和F管中加入: 10×连接缓冲液1.0μl 5mmol/LATP1.0μl H2O补至8.5μl 30%PEG80001~1.5μl 不加DNA酶 6.连接反应体系置于16℃水浴温育过夜或20℃水浴温育4h。 7.用每份稀释的连接产物转化感受态大肠杆菌。转化时,应包括用标准方法制备的已知量的超螺旋质粒DNA作为对照,以检查转化效率。 管号 DNA 连接酶(有/无) 预期转化克隆数 A 载体1 + ~03 B 插入片段 + 0 C 载体1和插入片段 + 比F管高5倍 D 载体1 - ~0 E 载体2 - 比D管高50倍 F 载体和插入片段 - 比D管高50倍 G 环状质粒 - 2×105 1去磷酸化 2未去磷酸化 3如果出现来自去磷酸化的载体DNA自身连接产物的转化子,是由于用碱性磷酸酶处理时未能除尽5’端的磷酸基。
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