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电泳分离的蛋白质肽谱和序列分析实验一方案12 胶内蛋白质的S吡啶乙基化实验
| 实验材料 | 通过电泳分离的凝胶内蛋白质 试剂、试剂盒 | β-巯基乙醇还原缓冲液 仪器、耗材 | 冷冻干燥离心机去离子水温箱冷冻干燥机小离心管移液管塑料皿
实验步骤 | 方法1:整块凝胶的还原和S-吡啶乙基化1.保证整块凝胶的正确染色和脱色(见方案9)。 2.在400~500ml水中清洗凝胶3次,约1.5h。 这一步骤是为了除去脱色液中的乙酸,否则乙酸会反方向地影响还原缓冲溶液的pH值。 3.将凝胶转移到一个干净的器皿中。 4.将凝胶浸在50ml的还原缓冲溶液中(体积取决于凝胶和器皿的大小)。在4℃孵育凝胶2h。 5.加入4-乙烯基吡啶到还原缓冲溶液中,终浓度为2%(体积分数)。避光室温孵育lh。 6.加人过量的2-巯基乙醇(终浓度2%,体积分数),以终止烷基化作用。 7.在400~500ml水中清洗凝胶3次,约1.5h。 这一步骤是为了除去/5-巯基乙醇,否则会干扰蛋白质水解。 8.如果蛋白质条带不再可见,重复染色和脱色步骤(见方案9)。 方法2:蛋白质条带的还原和S-吡啶乙基化1.保证整块凝胶的正确染色和脱色(见方案9)。 2.切下目标斑点或条带,放在干净的1.5ml聚丙烯小离心管中。 3.每次用Iml水彻底清洗切下来的凝胶,共3次,约45min。或者用冷冻干燥离心机完全使凝胶脱水。 4.从小离心管中弃掉去离子水。 5.加入足量的还原缓冲溶液,完全覆盖胶(通常100~200ul)。 脱水的凝胶吸收还原缓冲液后会膨胀。应确保有足够的还原缓冲液覆盖凝胶。 6.在40°C孵育凝胶lh。 7.加人4-乙烯基吡啶到还原缓冲溶液中,终浓度为2%(体积分数)。室温下避光孵育lh。 8.加人过量的/5-巯基乙醇(终浓度2%,体积分数),以终止烷基化作用。 9.用微量移液器或巴氏滴管吸去还原缓冲液,弃掉。 10.每次在1ml水中彻底清洗凝胶,共3次,约45min。
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