克隆基因

间接原位PCR(原位杂交PCR)

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实验材料
试剂、试剂盒
仪器、耗材
实验步骤
一、预杂交
 
1. 试剂与配制
 
2×SSC
 
50%去离子甲酰胺:用4×SSC配制(v/v)
 
预杂交液:2×SSC,5%硫酸葡聚糖,50%甲酰胺,0.2%脱脂奶粉
 
2. 操作方法
 
(1)在进行完原位PCR扩增后,用2×SSC预浸经乙醇脱水、空气干燥的玻片,并简洗15min;
 
(2)用50%去离子甲酰胺37℃孵育15min;
 
(3)加预杂交液20μl/片,在杂交温度下孵育30min~2h。
 
二、杂交
 
1. 试剂与配制
 
杂交液:50%去离子甲酰胺,5×SSC,10%硫酸葡聚糖,5×Denhardt’s液,2%SDS,10mg/ml变性的鲑鱼精DNA
 
2. 操作方法
 
(1)弃预杂交液,加杂交液(含0.2~5μg/ml探针)10~20μl/片,覆盖经硅化的盖玻片,石蜡膜封片或橡皮泥封片;
 
(2)玻片置于湿盒中,42℃杂交12~18h(过夜,但不能超过24h)。
 
三、杂交后处理
 
1. 试剂与配制
 
2×SSC
 
Rnase(20μg/ml)
 
50%去离子甲酰胺
 
10mmol/LDTT
 
2. 操作方法
 
1. 杂交完毕,用2×SSC浸泡玻片数分钟,轻轻移去盖玻片,再用2×SSC洗玻片1~2min;
 
2. 2×SSC(含20μg/mlRNase,适宜RNA探针,DNA探针可省略此步)中洗片30min,37℃;
 
3. 2×SSC/50%去离子甲酰胺,42℃×10min;
 
4. 1×SSC/50%去离子甲酰胺,37℃×30min,2次;
 
5. 4×SSC/10mmol/LDTT洗1h;
 
6. 0.1×SSC洗2次,每次37℃×30min;
 
7. PBS中洗10min,即可进行显色,方法同上。
注意事项
1. 如果检测mRNA,双链探针应变性处理,方法是95~100℃加热10min后迅速置于冰中骤冷;
 
2. 以单链探针检测DNA时,DNA也需变性处理,将玻片置于70~80℃变性液(70%去离子甲酰胺,即甲酰胺/2×SSC,v/v)中10min;
 
3. 用双链探针检测DNA时,可按上述方法变性处理。