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间接原位PCR(原位杂交PCR)
实验材料 | 组织或细胞样品 试剂、试剂盒 | SSC硫酸葡聚糖甲酰胺脱脂奶粉Denhardt’s液SDS变性的鲑鱼精DNARnaseDTT乙醇 仪器、耗材 | 玻片石蜡膜橡皮泥湿盒
实验步骤 | 一、预杂交 1. 试剂与配制 2×SSC 50%去离子甲酰胺:用4×SSC配制(v/v) 预杂交液:2×SSC,5%硫酸葡聚糖,50%甲酰胺,0.2%脱脂奶粉 2. 操作方法 (1)在进行完原位PCR扩增后,用2×SSC预浸经乙醇脱水、空气干燥的玻片,并简洗15min; (2)用50%去离子甲酰胺37℃孵育15min; (3)加预杂交液20μl/片,在杂交温度下孵育30min~2h。 二、杂交 1. 试剂与配制 杂交液:50%去离子甲酰胺,5×SSC,10%硫酸葡聚糖,5×Denhardt’s液,2%SDS,10mg/ml变性的鲑鱼精DNA 2. 操作方法 (1)弃预杂交液,加杂交液(含0.2~5μg/ml探针)10~20μl/片,覆盖经硅化的盖玻片,石蜡膜封片或橡皮泥封片; (2)玻片置于湿盒中,42℃杂交12~18h(过夜,但不能超过24h)。 三、杂交后处理 1. 试剂与配制 2×SSC Rnase(20μg/ml) 50%去离子甲酰胺 10mmol/LDTT 2. 操作方法 1. 杂交完毕,用2×SSC浸泡玻片数分钟,轻轻移去盖玻片,再用2×SSC洗玻片1~2min; 2. 2×SSC(含20μg/mlRNase,适宜RNA探针,DNA探针可省略此步)中洗片30min,37℃; 3. 2×SSC/50%去离子甲酰胺,42℃×10min; 4. 1×SSC/50%去离子甲酰胺,37℃×30min,2次; 5. 4×SSC/10mmol/LDTT洗1h; 6. 0.1×SSC洗2次,每次37℃×30min; 7. PBS中洗10min,即可进行显色,方法同上。 注意事项 | 1. 如果检测mRNA,双链探针应变性处理,方法是95~100℃加热10min后迅速置于冰中骤冷; 2. 以单链探针检测DNA时,DNA也需变性处理,将玻片置于70~80℃变性液(70%去离子甲酰胺,即甲酰胺/2×SSC,v/v)中10min; 3. 用双链探针检测DNA时,可按上述方法变性处理。
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