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miRNA芯片欧易生物
提供商: | 上海欧易生物医学科技有限公司 |
服务名称: | miRNA芯片 |
miRNA芯片应用
检测miRNA表达水平、差异miRNA筛选、差异miRNA靶基因预测
平台一 Agilent芯片平台
欧易生物是五年来唯一获得Agilent芯片认证的服务商
技术特点
■FDA认定最优,特殊的颈环探针专利设计,保证只识别成熟miRNA
■ 高度灵敏,可识别一个碱基差异,检测下限<0.1amol
■ 样品需求量低,最低上样量只需100ng总RNA
■ 不需要分离miRNA,避免丢失及引起误差
■ 宽的动态检测范围,检测丰度跨5个log,有利于检测到更宽丰度范围的miRNA
■ 高重复探针,每个miRNA至少重复20次
■ 良好的实验表现,平均CV<10%,R2﹥0.99
■ 表达丰度低的血浆、血清、体液、外泌体等亦可检测
芯片介绍
平台二 Affymetrix芯片平台
欧易生物是Affymetrix基因芯片官方认证服务商
技术特点
■全面覆盖SangermiRBaseV20.0数据库,同时检测203个物种的30,424个成熟的miRNA,其中5,214个人、大鼠和小鼠的成熟miRNA,参考数据库为SangermiRBaseV20.0、snoRNABase和Ensembl(BioMartExport)
■ 3,770个探针用于检测人类、小鼠、大鼠的miRNA前体
■ 高灵敏度:miRNA浓度大于1.0amol时,检出率达94%
■ 高重复性:技术重复相关系数达95%
■ 检测动态范围为4个log
芯片介绍
欧易特色
■ 完整的硬件系统:配备有芯片检测所需的所有仪器,包括杂交炉、扫描仪、2100样品质控系统等。
■ 完善的服务项目:可以提供miRNA芯片、测序、PCRArray和定量PCR等多种检测服务,已为上千位客户提供过相关服务。
■ 专业的技术操作人员:多年miRNA芯片实验的操作经验,具有丰富的样品处理经验和芯片经验。
■ 更个性化的生物信息分析服务:专业的生物信息分析团队,熟悉各种分析算法和软件;与客户充分互动,提供更多个性化分析思路和分析方案。
miRNA芯片分析流程
miRNA芯片技术参数
案例展示
案例一:子宫内膜癌miRNA机制研究[1]
图1.子宫内膜癌中差异表达的miRNA
案例二:子宫内膜异位症的miRNAbioMarker研究[2]
图2.子宫内膜异位症中差异表达的miRNA
案例三:老年性骨质疏松的关键分子-miR188[3]
图3.年龄诱导骨髓间充质干细胞中miRNA188的差异表达
案例四:miRNA与II型糖尿病[4]
图4.miRNA芯片检测和RT-PCR验证
参考文献
[1]BaoW,WangH,TianF,etal.ATrkB-STAT3-miR-204-5pregulatorycircuitrycontrolsproliferationandinvasionofendometrialcarcinomacells.MolCancer,2013;12:155.
[2]JiaS,YangY,LangJ,etal.PlasmamiR-17-5p,miR-20aandmiR-22aredown-regulatedinwomenwithendometriosis.HumanReproduction,2013;28(2):322-330.
[3]LiCJ,ChengP,LiangMK,etal.MicroRNA-188regulatesage-relatedswitchbetweenosteoblastandADIpocytedifferentiation.JClinInvest.2015;125(4):1509–1522.
[4]HuiminLu,LiuyiHao,SongtaoLin,etal.ElevatedcirculatingstearicacidleadstoamajorlipotoxiceffectonmousepancreaticbetacellsinhyperlipidaemiaviamiR-34a-5p-mediatedPERK/P53-dependentpathway.Diabetologia.2016Jun;59(6):1247-57.
【欧易合作项目】
转录组学测序、简化基因组测序、基因组重测序、捕获测序、表达谱芯片、miRNA芯片、lncRNA芯片、甲基化检测、酵母文库、微生物、SNP、蛋白定量、蛋白检测、代谢组学、其他(详情请登录欧易生物官方网站查看或电话咨询)
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