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利用寡核苷酸延伸法进行纯化DNA片段的放射性标记
随机引物法:利用寡核苷酸延伸法进行纯化DNA片段的放射性标记 1.在一个0.5ml的微量离心管中加入溶于30μl水的模板DNA(25ng)及1μl随机脱氧核苷酸引物(约125ng)。盖紧微量离心管,置于沸水浴中2min。 2.将微量离心管移至冰上放置1min,4℃下离心10s使引物与模板的混合物沉降至管底,将微量离心管重新置于冰上。 3.在引物与模板的混合物中加入: 5mmol/LdNTP溶液1μl 10mCi/ml[α-32P]dNTP5μl (比活性3000Ci/mmol) 水加至50μl 5×随机引物缓冲液: 250mmol/LTris(pH8.0) 25mmol/LMgCl2 100mmol/LNaCl 10mmol/L二硫苏糖醇(DTT) 1mol/LHEPES(用4mol/LNaOH调至pH6.6) 1mol/LDTT贮存于-20℃,临用前用水稀释,使用后弃去稀释的DTT 4.加入5单位(约1μl)的Klenow片段,轻弹管壁以混合各组分。以最大速度离心1~2s使所有液体沉降到管底。反应混合物室温下反应60min。 5.在反应液中加入10μlNA终止/贮存缓冲液,可根据需要进行以下步骤。 NA终止/贮存缓冲液: 50mmol/LTris-Cl(pH7.5) 50mmol/LNaCl 5mmol/LEDTA(pH8.0) 0.5%(m/V)SDS 贮存放射性标记的探针于-20℃以备杂交用。 或 通过离心柱层析分离放射性标记的探针与未结合的dNTP或以乙酸铵和乙醇选择性地沉淀放射性标记的DNA。如果>50%的放射性dNTP已在反应中掺入,可不进行该步骤。 另法 1.1.5ml微量离心管内依次加入: 10~200ng模板DNA(溶于1~9μl水) 灭菌双蒸水加至9μl 2.离心管加热至100℃5min即置入冰浴,短暂离心。 3.冰浴上依次加入: 2μl10×反应缓冲液 1μl0.5mmol/LdATP(终浓度25μmol/L) 1μl0.5mmol/LdGTP(终浓度25μmol/L) 1μl0.5mmol/LdTTP(终浓度25μmol/L) 5μlα-[32P]dCTP(终浓度0.83μmol/L) 1μl大肠杆菌DNA聚合酶IKlenow大片段(2U) 4.37℃温育30min。 5.当温育反应物时,同时制备SephadexG-50自旋转,2000×g离心2min。 6.加入2μl0.2mol/LEDTA(pH8.0)终止反应。反应混合液装样至自旋柱,2000×g离心4min。 7.取1μl柱洗脱液用液闪仪计数。用于杂交实验前,应将探针加热至100℃5min使之变性,随即置入冰浴5min。
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