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本人最近在用双向电泳技术研究一种细菌（H）不同血清型的两个菌株(H1和H2)的分泌蛋白差异，结果经双向电泳筛选出一些差异蛋白。之后挑取其中二个差异蛋白利用实时荧光定量PCR相对定量方法分析其转录水平。结果发现这两个蛋白在菌株H1的表达量远低于在菌株H2的表达，但是荧光定量PCR分析发现这两个蛋白的转录水平菌株H1是菌株H2的五十倍，现在正为此事烦恼，哪位高人能给些指点呢？
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回复：时间：2013-09-10
请问楼主有没有加内参？如果有内参，此种情况也有可能，proteomics或者J Proteomics 发表的文章也有这种情况的。在研究蛋白时，RT结果是次要的，仅供参考，建议楼主做个WB验证呀，若果WB没问题，那就没问题了，reviewer也不会质疑的。
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回复：时间：2013-09-11
rna水平的结果从某种程度上只是为蛋白水平的变化提供一种可能的机制。核心的依然是蛋白水平变化的数据。这个可以解释为这个蛋白在翻译水平及翻译后水平发生了丢失，菌株为了应对这种下调，反馈性的上调了转录水平。
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