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二代测序STR分型(HiSTR)
提供商: | 上海翼和 |
服务名称: | 二代测序STR分型(Hi-STR) |
STR(短串联重复序列),又称为微卫星标记或SSR。一般有2-6bp的核心序列串联重复而成,构成了STR基因座的遗传多态性。
STR/SSR具有分布广泛均匀、多态性丰富、遵循孟德尔共显性遗传、信息量大、检测简便等优点,STR/SSR分型高效快捷,结果准确,是非常重要的遗传标记,在遗传制图、连锁性分析、亲子鉴定、疾病基因定位和物种多态性研究等领域有着广泛的应用。
上海翼和生物微卫星分型服务:
根据具体实验规模,提供两种检测平台,分别为:适合中低通量检测的多重荧光PCRSTR/SSR分型服务和适合高通量的基于二代测序的Hi-STR分型服务。
Hi-STR分型服务
Hi-STR结合多重PCR技术和高通量测序技术,对需要检测的位点设计特异性引物,在单管内进行多重PCR扩增,不同的样本以不同的Barcode引物区分。混合样本后,在Ion Proton/Illumina主流测序平台上,对扩增子进行高通量测序。测序结果使用生物信息学方法,实现对STR位点的检测,与传统的凝胶电泳或毛细管电泳相比,可以直接根据序列,准确判断STR位点的重复次数。Hi-STR适用于核心重复区域3bp及以上的微卫星位点,配合各类高通量测序仪,使得STR分型具有更准确、更灵敏的特点,二代高通量测序,可将上千样本和STR位点混合检测,使检测更加高效经济。
技术路线:
翼和特色 | 内容 |
HI-STR分型 | 翼和自主知识产权超高重PCR捕获技术,技术先进,结果可靠 |
通量高,STR位点30-500个之间,数百数千样本推荐使用 | |
均一性高,95%扩增子测序深度在平均测序深度0.2X以上 | |
低样本浓度,DNA浓度>40ng/ul | |
检出率>95% | |
准确率>98%,可与荧光引物PCR分型方法相验证 |
本方法适用于动物植物及人类的遗传图谱绘制、QTL定位、生物多样性、动植物SSR位点检测、群体遗传结构等诸多领域。
上海翼和应用生物技术有限公司
服务热线:021- 33559491 021- 33559492
网址:http://www.biowing.com.cn/
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