测序酶

核酸纯化试剂盒用于二代测序文库分选直接替换AMPure XP

货号:BMSX
供应商:无锡百迈格生物科技有限公司
数量:现货
英文名:AMPureXP
保质期:一年
保存条件:室温
规格:5ml/50ml/其他

试剂盒组成

产品编号

规格

BMSX-5

5mL

BMSX-50

50mL

 

磁珠参数:

此试剂盒所用磁珠为无锡百迈格生物科技有限公司为NGS核酸片段筛选专门开发的磁珠(货号:BMS1000-2

试剂盒储存条件及稳定性

    试剂盒内组分室温保存即可,在适合的储存条件下该试剂盒未开封使用有效期为2年。

产品简介

   该试剂盒采用磁珠纯化方式,适用于高通量测序文库(NGS)构建中DNA片段大小快速分选和回收。DNA片段筛选试剂盒的结合缓冲液中含有超顺磁珠,根据磁珠悬浮液和样品的体积比可选择性结合DNA片段。经过磁性分离和乙醇清洗,低盐洗脱缓冲液或无核酸酶水洗脱的高纯度的DNA片段不含有核苷酸引物接头,酶和盐等污染物可被直接用于下游应用,比如:酶切、测序、杂交、PCR反应等后续操作。应用于手动或自动液体操作设备。

产品优势

1.适合DNA的片段范围广:100bp~50kb

2.回收率高:回收率高达80%以上;

3.DNA纯度高:回收的PCR产物纯度高;

4.操作快速简单:20min即可完成整个操作流程,无需离心;

5.可适用于自动化、高通量PCR产物纯化。

6.该试剂盒使用步骤和国外BeckmanAmpureXP高度一致,直接替换

7.价格低,订货期短等明显优势。

产品原理

图1(核酸纯化试剂盒大致工作原理)

自备仪器和试剂

1.磁力架(建议使用百迈格生物磁力架,货号:BMB16-0.2)。

2.洗涤液:80%乙醇水溶液。

3.洗脱液:BufferEB10mMTris-HClpH8.0);或者RNase-FreeWater

操作步骤

请参考BeckmanAmpureXP产品,直接替换。

性能实例:

1.核酸片段筛选测试:

测试目的:通过DNA片段筛选测试自主研发试剂盒与国外进口试剂盒性能差异

1)测试平台:安捷伦2100生物分析仪

2)实验方法:将大片段DNA打断后添加磁珠纯化试剂盒进行片段筛选,运用两步法对样品进行核酸片段筛选回收

2如下:

 

               

 图2,安捷伦2100生物分析仪片段选择对比测试结果:自主研发试剂盒与国际商品化品牌AmpureXP试剂盒核酸片段回收对比(左图为AmpureXP品牌核酸纯化试剂盒安捷伦2100生物分析仪检测回收核酸平均片段大小,平均片段大小为265;右图为自主研发核酸纯化试剂盒利用安捷伦2100生物分析仪检测回收核酸平均片段大小,平均片段大小为265对比结果十分接近

2.DNA回收效率测试

测试目的:检测对DNA片段的回收效率

实验方案:大片段DNA打断后,经试剂盒一步法纯化后(1.8X)测试DNA回收效率

3如下:

测试品牌

DNA总投入量

纯化后DNA回收效率(%)

AmpureXP-1

5ug

84.20%

AmpureXP-2

5ug

83.87%

自主研发试剂盒-1

5ug

84.40%

自主研发试剂盒-2

5ug

84.12%

 由表3可以看出,DNA回收效率测试结果相近,都达到80%以上。

3.主流测序仪测序测试

测试目的:通过市面上主流基因测序仪平台检验试剂盒稳定性

1)测试平台:Proton测序平台

2)实验步骤:生物样本提取出核酸后进行文库制备+上机测序

3)核酸样品总数12个:6个对照品,6个测试品,其中文库制备部分,分别采用本公司自主研发的纯化试剂盒AmpureXP商品化试剂盒进行核酸纯化。

表4如下:

Proton平台测试结果

对照组(AmpureXP)

测试组(自主研发)

对比值

唯一比对率

5.17

5.42

0.25

GC含量平均值

41.14

40.85

 -0.29

原始数据积累平均值

6.88

7.33

0.45

根据表4体现的Proton测序分析结果看,表4中的唯一比对率与原始数据积累平均值越高越好,GC含量平均值对照组与测试组均符合标准。经测试结果分析,自主研发核酸纯化试剂盒对比进口商品化试剂盒性能相差无异,能够有效的替代进口的磁珠纯化试剂盒。


温馨提示:不可用于临床治疗。

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