定量PCR

免疫PCR技术

(一)材料与方法1.生物素标记特异性抗体的制备免疫球蛋白(如IgG、IgM)的Fc片段上有糖基存在,因而可用能与糖基结合的Biotin-hydrazide作生物素标记。(1)将纯化的抗体(IgM或IgG,0.1~1.0ml)在标记缓冲液(0.1Mol/LNaAc,pH值5.5,0.1Mol/LNaCl)中4℃透析过夜。(2)吸取0.5ml至微量离心管中,加过碘酸钠溶液至终浓度为10mMol/L,置冰浴上于暗处孵育30min,使抗体分子上的糖基氧化。(3)将氧化的抗体过PBS平衡的SephadexG25PD-10预装柱,使之与过碘酸钠分开。收集蛋白峰。(4)向抗体管中加入Biotin-LC-hydrazide(Pierce)至终浓度5mMol/L,置混摇器上室温孵育1h。(5)用含0.02%NaN3的PBS平衡SephadexG25预装柱,将生物素标记的抗体分子过柱与游离的生物素分开。收集蛋白峰,保存-20℃。2.生物素标记DNA片段的制备作为将与抗体偶联的报告DNA片段,应确保在待测抗原来源的机体DNA中无同源序列,如可选用大肠杆菌的序列作为报告DNA去检测人源的标本。DNA片段大小为300~500bp,生物素标记可采用PCR方法,根据报告DNA的核苷酸序列合成一对引物,其中一个引物的5’端碱基上带有生物素标记。在0.5mlPCR管中按表将下列试剂混合。表PCR系统组成试剂添加量终浓度10×PCR缓冲液10.0ul1×2.5mMol/L4dNTP混合物8.0ul0.2mMol/L50uMol/L生物素标记的上游引物1.0ul0.5uMol/l50uMol/L生物素标记的下游引物1.0ul0.5uMol/l15mMol/L模板DNA1.0ul1.0ugTaqDNA聚合酶1.0ul5U加水至100uL混匀后上面覆盖液体石蜡。95℃加热5min,然后在PCR仪上按下列程序扩增:94℃1min;55℃1min;72℃1min;40个循环。最后72℃延伸10min。加等量酚-氯仿抽提,然后加10ul3Mol/LKac,250uL无水乙醇,置-70℃30min。离心沉淀DNA片段,用70%乙醇洗一次。将沉淀DNA干燥后溶于TE缓冲液中,保存在-20℃。3.制备抗体-亲和素-DNA复合物将生物素标记的抗体与亲和素按等分子浓度混合于含有1mg/mlBSA的PBS中,室温孵育30min,再加入两倍分子浓度的生物素标记的DNA片段,继续孵育30min,最后加入10倍分子浓度的生物素,将亲和素分子上的结合部位饱和。最后过凝胶过滤柱将复合物与未结合的单体分开,加入BSA达1mg/ml,分装后冻存于-20℃。4.免疫PCR(1)按常规ELISA方法,用饱和缓冲液稀释抗原,加到96孔塑料板或0.5mlPCR管中,4℃过夜。(2)用PBS洗三次,然后每孔加200ul封闭液(PBS含10mg/mlBSA,1mg/ml鱼精DNA),室温孵育30min。(3)用TETBS(其配方:20mMol/LEDTA,0.02%NaN3)洗三次。(4)将抗体-亲和素-DNA复合物稀释于含有1mg/mlBSA和0.1mg/ml鱼精DNA的TETBS中,每孔加50ul,室温孵育1h。(5)用TETBS洗5次,然后将塑料板或管倒置在吸水纸上拍打以控干水分。(6)每管中加50ulPCR反应液,含有表成分:

表PCR反应液试剂添加量终浓度10×PCR缓冲液5.0μl1×2.5mMol/L4dNTP混合物4.0μl0.2mMol/L50uMol/L生物素标记的上游引物0.5μl0.5μMol/l50uMol/L生物素标记的下游引物0.5μl0.5μMol/l15mMol/LMgCl25.0μl1.5μgTaqDNA聚合酶0.5μl2.5U加水至50μL混匀后上面覆盖液体石蜡。95℃加热5min,然后在PCR仪上按下列程序扩增35个循环:94℃1min;55℃1min;72℃1min。最后72℃延伸10min。每管取5ul作琼脂糖或聚丙烯酰胺凝胶电泳,溴化乙锭染色后观察结果,如在PCR时加入了放射性核素标记,则可用X光片显影。亦可在凝胶电泳后做Southern-blot,用特异性探针杂交,进一步提高其特异性和敏感性。 (二)注意事项本实验的关键步骤是获得适当的抗体-DNA复合物。用链亲和素将生物素标记的抗体与生物素标记的DNA偶联的方法,因每个链亲和素分子可与四个生物素分子结合,因此要优化反应条件,以使得每个链亲和素分子既能结合上抗体分子,又能结合上DNA片段。此外,还可用化学方法将DNA片段与抗体分子共价偶联,即将抗体分子和5’端氨基酸修饰的DNA片段分别用不同的双功能偶联剂激活,然后通过自发的反应偶联到一起,比如,用N-Succinimidyl-S-acetylthioacetate(SATA)活化氨基修饰的DNA片段,用Sulfo-Succinimidyl4-(maleimidomethyl)Cyclohexane-1-Carboxylate(Sulfo-SMCC)修饰抗体分子,然后将二者在一小管中混合,通过加入盐酸胲(Hydroxylaminehydrochloride)使二者偶联在一起。免疫PCR具有高敏感性。因此,抗体和标记DNA的任何非特异性结合均可导致严重的本底问题。因而在加入抗体和标记DNA后必须尽可能彻底地清洗。即使有些特异性结合的抗体或标记DNA被洗掉了,亦可在最后通过增加PCR的循环次数得到弥补。此外,应用有效的封闭剂对防止非特异性结合也是非常重要的。可用脱脂奶粉和牛血清白蛋白做蛋白封闭剂,用鱼精DNA做核酸封闭剂。防止本底信号的另一个重要因素是控制污染,这也是所有敏感的检测系统存在的问题。即使每一步试验都做得非常认真,重复使用同样的引物和标记DNA均会产生假阳性信号。免疫PCR的一个优点是标记DNA序列完全是人为选定。因此标记DNA及其引物可经常变换,以避免由于污染造成的假阳性信号。免疫PCR可以检测到常规免疫学方法无法检测的样品。因此,应用免疫PCR可在微观水平(单细胞)检测抗原,定量PCR产物可以估计某一标本中的抗原数量,在临床诊断中可在疾病早期抗原量很低时检测到微量的抗原。

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