RNA提取纯化试剂

通过CsCl 等密度梯度离心纯化λ噬菌体颗粒实验

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实验方法原理CsCl等密度梯度离心用于制备最高纯度的感染性λ噬菌体颗粒,它没有任何细菌核酸的污染。从这种噬菌体颗粒中提取的DNA可用作DNA测序的模板、亚克隆至质粒载体和产生用于原位杂交的探针。这种方法第二个优点是,由它所获得的噬菌体原种是高度浓缩的(大于1011cfu/ml),在4℃保存时,许多年后仍能保持它们的感染力。
实验材料
试剂、试剂盒
仪器、耗材
实验步骤
一、材料

1.缓冲液和溶液

(1)CsCl(固体)

(2)CsCl溶液



(3)乙醇

2.离心机和转子

(1)BeckmanSW41或SW28转子或相当型号

(2)BeckmanTi50或SW50.1转子或相当型号,配有清亮的离心管(如Beckman超亮离心管)

3.专用设备

皮下注射用针头(21号)

4.载体和菌株

λ噬菌体悬浮液

二、方法

1.测定噬菌体悬浮液的体积,每毫升加入0.5g固体CsCl,搅拌混匀使其完全溶解。

2.倒入足够量的CsCl分级梯度,使噬菌体悬浮液分成几个组分,每个梯度能容纳约16ml噬菌体悬浮液。所需分级梯度的量等于亲水相的最终体积(步骤1),亲水相又被分成数份,每份为0.4X离心管体积。用适合于BeckmanSW41或SW28转子(或相当型号)的清亮塑料离心管(如Beckman超亮离心管)。



3.在ρ=1.50g/ml和ρ=1.45g/ml两层界面的相应试管壁外侧,用永久性标签笔作上标记。



CsCl分级梯度大约占超离管体积的60%。比如,对一个能装38ml的BeckmanSW28试管(或相当型号),分级梯度由三种均为7.6ml的CsCl溶液组成。平衡管装有同样密度的CsCl溶液。

4.小心地将噬菌体悬浮液加至分级梯度上,4℃,87000g(22000r/min于BeckmanSW28转子中)离心2h。

5.按下面的方法对离心管进行穿孔,以收集噬菌体颗粒。

(1)用酒精仔细地擦去离心管外的油污,然后在离心管的外侧贴上Scotch胶带,与噬菌体颗粒带平齐。

胶带起到封条的作用,防止针头四周渗漏。

(2)用21号皮下注射用针头(不需要注射针筒)穿过胶带刺入离心管,收集噬菌体颗粒带。



手指远离针头刺入方向,以免剌穿离心管。注意不要使梯度中其他带内物质污染噬菌体颗粒。这些带内含有细胞碎片和未装配的噬菌体成分。

6.将噬菌体颗粒悬浮液装入适宜于BeckmanTi50或SW50.1转子(或相当型号)的超离管中,加入CsCl溶液(ρ=1.5g/ml于SM中)。4℃,150000g(41000r/min于BeckmanTi50转子中)离心24h或160000g(36000r/min于BeckmanSW50.1转子中)离心24h。



7.如步骤5所述收集噬菌体颗粒带,于CsCl溶液中4℃密封保存于一试管中。

8.(可供选择)如果必要,噬菌体颗粒可通过新一轮的CsCl平衡梯度离心进一步纯化和浓缩。将噬菌体悬浮液转移至适宜于BeckmanSW50.1转子(或相当型号)的一个或多个超离管中,加入CsCl溶液(ρ=1.5g/ml于SM中),160000g(36000r/min于BecrkmanSW50.1转子中)4℃离心24h。当离心完成后,如下面“替代方案”的步骤3和4所述收集噬菌体颗粒。