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Linker Ligation
LinkerLigation(withT4DNALigase)
- Inamicrocentrifugetubeprepareasolutionofbluntended,dephosphorylatedDNA(100-500ng)inTEbuffer(5-7µl).
- Add1-2µgofphosphorylatedlinkersin5µlofTEbuffer.
- Add:
- 10Xligationbuffer2µl,
- 50%PEG4000solution2µl,
- deionizedwaterto20µl,
- T4DNALigase2u.Vortexthetubeandspindowninamicrocentrifugefor3-5seconds.
- Incubatethemixturefor1hourat22°C.
- InactivateT4DNALigasebyheatingthereactionmixtureat65°Cfor10minutes.Theresultingligationproductscanbedigesteddirectlywithrestrictionendonucleases.
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