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干细胞是重要细胞,其能够自我更新或者分化成多种类型的细胞,这种能力由细胞信号传导和转录调控所控制,因此转录调控在细胞识别和功能实现过程中起决定作用。干细胞逐步成熟成为终末分化细胞,需要由重要的转录因子适时的激活级联转录程序,多种转录因子和靶基因广泛报告与干细胞的自我更新和多能性有关,包括EGR1、OCT4、FOXD3、FOXO、Nanog、SOX2、SOX18、ETS、GLI、KLF4、MEF2、Myc、RNUX1、Pax6、TCF/LEF和GATA。分析这些TF的活性可以为干细胞的研究和应用提供有价值的线索。美国Signosis公司开发一种干细胞转录因子活性多重检测阵列试剂,以同时分析哺乳动物样本中16种干细胞特异的TF,该方法可以用1000—10000个细胞的全细胞裂解物进行。
A.优点:
多重分析——一次分析可以检测16种干细胞相关的TF
定量比较——二个样本的差异可以定量分析和比较
步骤简单——探针温育、柱分离、板杂交和HRP检测
无需贵重仪器——无需如Luminex那样的贵重仪器
B.原理:
干细胞转录因子活性多重检测阵列试剂用于同时检测多种TF活性。该技术中,基于TFDNA结合位点的一致性序列,制备一系列生物素标记的探针。当探针混合物与核提取物一起温育时,每个探针寻找相应的TF,形成TF/探针复合物,通过柱离心纯化可以很容易与游离探针分开。结合的探针从混合物中分离出来,通过板杂交分析。板孔中预包被上与探针互补的特异序列,捕获的DNA探针进一步用链酶亲和素-HRP检测,化学发光检测仪测定发光强度(RLUs)。
A.优点:
多重分析——一次分析可以检测16种干细胞相关的TF
定量比较——二个样本的差异可以定量分析和比较
步骤简单——探针温育、柱分离、板杂交和HRP检测
无需贵重仪器——无需如Luminex那样的贵重仪器
B.原理:
干细胞转录因子活性多重检测阵列试剂用于同时检测多种TF活性。该技术中,基于TFDNA结合位点的一致性序列,制备一系列生物素标记的探针。当探针混合物与核提取物一起温育时,每个探针寻找相应的TF,形成TF/探针复合物,通过柱离心纯化可以很容易与游离探针分开。结合的探针从混合物中分离出来,通过板杂交分析。板孔中预包被上与探针互补的特异序列,捕获的DNA探针进一步用链酶亲和素-HRP检测,化学发光检测仪测定发光强度(RLUs)。
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