核苷酸

使用合成核苷酸作探针实验一在氯化钠/柠檬酸钠中杂交

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实验材料
试剂、试剂盒
仪器、耗材
实验步骤
1. 制备双份的转印细菌菌落或噬斑的硝酸纤维素滤膜(处理和干烤过)。

2. 在室温下用3×SDS/0.1%SDS溶液500ml洗膜3~5次。

3. 然后在65℃洗膜至少1.5h以上直至过夜。
 
4. 在预杂交液中37℃预杂交1h。
 
5. 在装有20ml以上的SSC杂交液的可封口的杂交袋中可移入多达20张的滤膜。

6. 在毎个杂交袋中每毫升杂交液加入0.125ng至1.0ng的每种32P标记的寡核苷酸。

7. 在以下给定的温度条件下寡核苷酸杂交14~48h。

(1)14碱基——室温

(2)17碱基——37℃

(3)20碱基——42℃

(4)23碱基——48℃
 
8. 从杂交袋中取出滤胰,用6×SSC/0.05%焦磷酸盐洗膜液在室温冼膜3~5次,每次5~15min。

9. 再用预热的洗膜液洗膜30min。预热温度与寡核苷酸片段长度有关。

(1)14碱基——37℃

(2)17碱基——48℃

(3)20碱基——55℃

(4)23碱基——60℃
 
10. 如果滤膜高于本底放射性活性,则需要将洗膜温度升高2~3℃,并延长洗膜15~30min。

11. 重新作放射自显影检测。但不得超过以下对应的温度:

(1)14碱基——41℃

(2)17碱基——53℃

(3)20碱基——63℃

(4)23碱基——70℃
 
12. 用塑料薄膜包裹滤膜,放好,使用增感屏在-70℃对X光片曝光14~72h,双份滤膜均对X光片曝光,如果在同一位置出现曝光点,那么该位置对应的细菌菌落或噬斑为阳性。