电泳仪

通过凝胶电泳测定λ噬菌体原种和裂解物中DNA的含量实验

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实验方法原理本方案阐述了一种快速估计λ噬菌体原种中DNA含量的方法。该方法首先可用于发现原种和裂解物中的噬菌体颗粒的得率是否能满足大量纯化的需要,其次可用于检测纯化过程,以找到出问题步骤。
实验材料
试剂、试剂盒
仪器、耗材
实验步骤
一、材料

1.缓冲液和溶液

2.5XSDS-EDTA染料混合物

2.酶和缓冲液

DNaseⅠ稀释缓冲液,胰DNaseⅠ(1mg/ml)

3.凝胶

琼脂糖凝胶(0.7%),用0.5XTBE,含0.5μg/ml溴化乙锭

4.核酸和寡核苷酸

λ噬菌体DNA(对照DNA)

5.专用设备

预置于65℃的水浴

6.载体和菌株

λ噬菌体裂解物或原种

二、方法

1.按如下方法配置胰DNaseⅠ的工作液(1μg/ml):1μlDNaseⅠ储液加1ml冰冷的DnaseⅠ稀释缓冲液进行稀释。

2.将封口的试管轻轻上下颠倒数次使溶液混匀,注意别产生气泡和泡沬。在使用前将工作液贮存于冰浴中,用后舍弃。

平板裂解物的粗制品得到一条清晰的λ噬菌体DNA带。但是,液体裂解物一般含细菌DNA片段,在琼脂糖凝胶中将干扰噬菌体DNA带。在用SDS和EDTA处理释放λDNA之前,先用胰DNaseⅠ处理噬菌体颗粒,将能避免该问题的产生。

3.将10μl噬菌体裂解物或原种的粗制品转移至一微量离心管中,加1μl胰DNase工作液,37℃温育30min。

4.加入4μl2.5XSDS-EDTA染料混合物,65℃温育5min。

这一步使噬菌体的外壳破裂,释放病毒DNA,同时使DNase失活。

5.将样品上样于含0.5μg/ml溴化乙锭的0.7%琼脂糖凝胶中。

用5ng、25ng和100ng的λ噬菌体DNA作对照。

6.在小于5V/cm的电场下电泳,直到溴酚蓝迁移3~4cm。

如果电压太高,DNA带将出现拖尾现象。

7.在紫外线下观察凝胶。用标准DNA的荧光密度作对照,估算测试样品中λ噬菌体DNA的量。

10μl的高滴度裂解物应含有10~50ng的噬菌体DNA。