2021-08-15EST序列的基因克隆

利用计算机协助克隆基称电基克隆（sillcon cloning）与定位克隆、定位候选克隆策略并列即采用物信息延伸EST序列获基部乃至全cDNA序列EST数据库迅速扩张已经并继续导致识别与克隆新基策略发革命性变化4.1EST序列获取利用计算机协助克隆第步必须获兴趣ESTdbEST数据库找EST途径寻找同源序列标准：度≥100bp同源性50%、85%通数万维网界使用BLAST检索程度实现其用NCBI（National Center for Biotechnology Information）GenBank、意利TigemESTmachine（包括EST提取者EST组装机器）、THC（Tentative Human Consensus Sequences）数据库、ESTBlast检索程序——通英类基组作图项目资源（Human Genome Mapping Project Resource CenterHGMP—RC）服务器访问检序列组装重叠群（contig）重叠群检序列重复进行BLAST检索与序列组装延伸重叠系列重复程直没更重叠EST检或者说重叠群序列能继续延伸获全基编码序列获些EST序列数据再与GeneBank核酸数据库进行相似性检测假凤精确匹配基EST序列数据据EST六种阅读框翻译蛋白质接着与蛋白质序列数据库进行比较析基析结致三种：第已知基研究象类已鉴定解基；第二前未经鉴定新基；第三未知基部基间同种或异种基匹配新基未知基进步用于物研究4.2基电定位基电定位采用NCBI电PCR程序进行检索寻找EST序列否存序列标签位点（sequence tagged sites,STS）STS作基组单拷贝序列新代遗传标记系统其数目覆盖密度较达平均每1kbSTS或更密集寻找STS与相应染色体相比较即序列定位该染色体4.3IMAGE克隆索取许ESTs所应cDNA克隆通基组及其表达整合析（intergrated molecular analysis of genomes and their expressionIMAGE）协定免疫索取与电基克隆相辅相IMAGE协定由美LLNL家实验室主持宗旨共享排列cDNA文库克隆重规模EST测序项目Merk&Cow公司投资类ESTs项目等都加入IMAGE协定研究者通另外途径基部序列并通同源性检索发现该片段与加入IMAGE协定EST序列高度同源便免费索取其原始克隆通美ATCC组织（American Type Culture Collection）索取避免或减轻筛选全基麻烦集精力进行基功能研究图" class="ikqb_img_alink">