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回复:时间:2007-04-11
其它都好理解,只是搞不懂包被RecA和重组酶的作用是什么?感觉有点多余,不用它也应该可以的,类似的实验有很多。不知道是不是可能ActiveMotif公司为了避开别人的专利才搞这么玄乎?请高人指教!如果不用RecA,试剂自己单独购买,应该能节约不少银子,还可练手。
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回复:时间:2007-04-11
抛砖引玉。我先来讲一些基础的,大家补充。先说一下recA重组酶和recA同源重组系统。理解了recA重组酶的作用,就好理解这个kit的原理和操作方法了。那么就晓得能不能改进和DIY了。嘿嘿,按mylab战友的说法,可以单独购买试剂节约银子了。recA介导的同源重组是原核生物DNA修复功能的主要执行者。recA蛋白是一个39ku的单链蛋白,其主要作用是促进DNA同源片段的配对以及DNA分子间的单链交换,并形成稳定的重组产物。但对于加与反应的底物DNA分子具备在个条件:1,DNA分子间或分子内存在较高的同源序列,2,至少一种DNA底物是单链,3,至少一条DNA链具有自由末端。在中性pH条件下,recA能大量结合于单链DNA,每个单体与单链DNA上的3-5个碱基结合,而且这种结合作用呈现高度的协同效应。此外,recA还具有依赖pH和ATP的双链DNA结合活性。TheRecAproteinusedintheRecActiveKitisamulti-functionalE.coliDNA-bindingproteinthatplaysintegralrolesinbothhomologousrecombinationandpost-replicativeDNArepair.RecAcatalyzesthepairingofsingle-strandedDNA(ssDNA)withcomplementaryregionsofdouble-strandedDNA(dsDNA).RecAmonomersfirstpolymerizetoformahelicalfilamentaroundssDNA.DuplexDNAthenbindstothepolymer.BounddsDNApartiallyunwindstofacilitatebasepairingbetweenssDNAandduplexedDNA.OncessDNAhashybridizedtoaregionofdsDNA,theduplexedDNAfurtherunwindstoallowforbranchmigration.RecAhasabindingsiteforATP,thehydrolysisofwhichisrequiredforreleaseoftheDNAstrandsfromRecAfilaments.如果没有recA蛋白,探针杂交可以执行,但就达不到“Theuseofhomologousrecombinationenzymesandkineticallytrappedmulti-strandedDNAhybridsenablesDNAtobetargetedinitsnatural,non-denatured,double-strandedstateatvirtuallyanyDNAsequence”的效果了。变性转移到纤维素膜上的的全长CDNA怎么还能进行后续的转化、克隆实验呢?嘿嘿,看来,这个东东还是要保留的。有兴趣的战友再看看这个protocol吧。recActive.rar(277.48k)
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回复:时间:2007-04-06
感谢raimi版主的指教。看来用recA的确是不错的主意。不过,我以前实验室还用过更简洁的方法(我自己没做这个实验,大概步骤如下):1.PCR标记Biotin探针,相同。2.过量探针与文库DNA混合,变性、退火(与一个PCR循环类似,但时间长一些)。3.用亲合素包被的磁珠富积。交换液体。4.去掉磁场。5.将富积产物高温变性。保持高温加磁场。6.取出的液体即为你需要的东东。两个高温变性就可以解决问题,效果还不错。完全可以DIY的。
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回复:时间:2007-04-05
mylab实验室使用的方法应该是用于富集筛选SSR引物的一种方法,但是真正要用于筛同源基因则可能不太适合。目前我们实验室正在使用ActiveMotif的试剂盒筛选基因组文库,似乎效果不错。
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