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大量细菌克隆的杂交方法筛选实验

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实验方法原理这一方法由Hanahan和Meselson(1980,1983)报道,主要用来处理由质粒CDNA文库转化的细菌。将转化菌的混合物或者一份扩增的cDNA文库直接置于不含洗涤剂的硝酸纤维素膜或尼龙膜上,复制膜用膜-膜接触的方法制备。采用这一方法,每块150mm板上的2X104克隆或每块90mm板上的1X104克隆可以被复制,并作进一步杂交筛选。
实验材料
仪器、耗材
实验步骤
一、材料

1.培养基

(1)含有适当抗菌素的LB或SOB琼脂板。

本方案中使用2~3天旧板效果最好,因为旧板更容易吸收接种物中的水分。

(2)含有适当抗菌素和25%(V/V)甘油的LB或SOB琼脂板。

(3)含有氯霉素的LB或SOB琼脂板。

氯霉素贮存液浓度应为170~200μg/ml。

2.专用设备

平头镊子(如Millipore镊子)

18号针头

硝酸纤维素膜(MilliporeHATF,或相当产品)或尼龙膜,无菌无去污剂污染

注射器(3cc)

Whatman3MM圆形滤纸。(提前准备一叠Whatman3MM滤纸(毎一硝酸纤维素或尼龙膜各准备一叠,还要加一些备用品),并裁减成比滤膜稍大一点。一些厂家已有预制好的圆形滤纸出售。用铅箔包好滤纸,高温高压消毒[15psi(1.05kg/cm2)10min]。

3.载体和菌种

重组质粒转化的E.coli,用作培养物。



扩增的cDNA文库,生长为培养物。

二、方法

1.用软铅铅笔或圆珠笔在干滤膜上作好标记,用水浸湿后将湿滤膜夹在干的3MM滤纸之间,用铝箔松散地包好,液相循环高温高压消毒[15psi(1.05kg/cm2)10min]。

准备足够的滤膜用来从起始板制备1或2张备份。备份最好用消毒的无菌滤膜,但如果不再从主板制备备份,未消毒的滤膜也可以用。

2.用平头镊子将一张消过毒的滤膜,标记面向下,置于含有适当抗菌素的LB或SOB琼脂板已制备2~3天,滤膜完全浸湿后,将其从板上揭下,翻过来标记面向上,再置于琼脂板表面。

3.将小体积的菌液置于琼脂板表面的滤膜中心,用一个无菌玻璃棒使菌液分散,在滤膜四周留出2~3mm宽的无菌区。

大滤膜(直径137mm)可提供0.5ml细菌悬液,含2X104个活菌;小滤膜(直径82mm)提供0.2ml细菌悬液,含~104个活菌。

4.将琼脂板的盖半开(不要倒置)置于通风橱内数分钟使接种物中的水分蒸发,盖上盖子,颠倒琼脂板于37℃培养直至出现直径0.1~0.2mm的小菌落(约8~10h)。

5.如需要,可在此时按步骤6制备备份滤膜,否则按以下步骤使菌落可冻存于-20℃:

(1)将滤膜菌落面向上转移至含有适当抗菌素和25%甘油的LB或SOB琼脂板表面。

(2)于37℃培养2h。

如进行cDNA文库筛选,最好将主板冰冻。冰冻可减少真菌污染使主板保存数月。含有抗菌素但不含甘油的LB或SOB板上的主滤膜可在4℃保存2周。

(3)用Parafilm膜封好琼脂板,颠倒置于封闭的塑料袋的于-20℃保存。

于室温使主板(仍以颠倒位置)解冻后即可制作备份。

6.将主膜(硝酸纤维膜或尼龙膜)菌落面上置于无菌的Whatman3MM滤纸上。

7.标记一张湿的硝酸纤维膜或尼龙膜,置于主膜上,防治在两膜之间形成气泡。

最好将第二张滤膜稍微卷曲,以使两张滤膜首先在中部接触。两膜一旦接触,就不要相互移动。尽量使两张滤膜不要完全重叠,以便于以后使两者分离。

8.在滤膜上再盖一张圆形3MM滤纸,并在滤纸上放一个培养皿,用手掌向下紧压培养皿以使细菌从主膜转到滤膜上。

9.拿掉培养皿和顶层3MM滤纸,用连接注射器的18号针头在双层滤膜作一些空,以作标记方位。

确保针头剌穿两层滤膜。

10.使两膜分开,将备份膜置于新鲜的含有适当抗菌素的LB(或SOB)琼脂板。

此时,可按步制备第二张备份,用主膜上已有的孔标记第二张备份膜。

11.将另一张备份膜和主膜置于新鲜的含有适当抗菌素的LB(或SOB)琼脂板,于37℃培养,直到长出菌落(4~6h)。

12.这一阶段,当细菌生长依然很快,滤膜可以转到含有氯霉素的(170~200μg/ml)的(或SOB)琼脂板,于37℃培养12h。

13.将主膜转到新鮮的含有适当抗菌素和25%甘油的LB(或SOB)琼脂板,而后按步骤5冻存。

14.裂解附着于备份膜上菌落,将释放出的DNA固定于硝酸纤维膜或尼龙膜。进行杂交。