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回复:时间:2017-09-02
需要引物。我笔记上写的是病毒tRNA中含有引物,具体原因忘啦。逆转录酶又叫依赖RNA的DNA聚合酶,~~既然是DNA聚合酶,那么生成DNA就得需要引物吧。
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回复:时间:2017-08-31
seuzsl我没有做过血浆中miR楼主,刚设计遇到麻烦,miR引物序列为:GGUGGCCCGGCCGUGCCUGAGG;由于GC含量太高,无法使Tm值降至60左右,加AT好像要加很多很多,有没有更好的办法?
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回复:时间:2017-08-31
楼主您好:1、谢谢楼主能做设计出这么好的软件来2、新人学习,我不太明白您的反转录特异引物是在某篇文献中找的,还是。。。因为我从别的文献中看到过其他的特异性引物。。3、特异性引物是什么动物都可以用么??还是每种动物都有不同的特异性引物?我做的是小鼠骨骼肌的MIRNA
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回复:时间:2017-08-31
jandrea楼主,我想请问下,你的这个茎环序列是怎么确定的呢。你的这个反转录用的内参是哪个,U6吗?GAPDH可以用吗?因为是新手,所以好多问题都不太清楚。序列是文献报道的,当然你也可以自己设计可以用U6。GAPDH是mRNA的内参
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回复:时间:2017-08-30
最近设计引物,用到楼主的小软件,很方便,赞一个!想请教一个问题。由于miRNA序列的特异性,为避免引物二聚体的ΔG过大,茎环尾加长度需要设为9。请问,你有没有使用过这么长的茎环尾加长度?你估计这样设计行得通不?
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回复:时间:2017-09-04
绿色的地球最近设计引物,用到楼主的小软件,很方便,赞一个!想请教一个问题。由于miRNA序列的特异性,为避免引物二聚体的ΔG过大,茎环尾加长度需要设为9。请问,你有没有使用过这么长的茎环尾加长度?你估计这样设计行得通不?一般尾部加8个,9个也可以
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回复:时间:2017-08-30
帖子已被删除1、比如miRNA序列中连续的CCC比较多,那么你就不能再在5‘端增加GGG,而是增加CCC;你增加CG后如果有发卡结构,软件也会提示的2、可以加,只能在5’端加3、主要看TM值,两个引物接近为主但是有时候难以设计出非常理想的引物,即使primer3.0提示引物存在问题,照样可以扩增的
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回复:时间:2017-08-26
展开引用seuzsl1、比如miRNA序列中连续的CCC比较多,那么你就不能再在5‘端增加GGG,而是增加CCC;你增加CG后如果有发卡结构,软件也会提示的2、可以加,只能在5’端加3、主要看TM值,两个引物接近为主但是有时候难以设计出非常理想的引物,即使primer3.0提示引物存在问题,照样可以扩增的......非常感谢您的回复,神速啊,你的回复很有用,已经摸索一个多月了效果还是不好,有两个目的基因扩增不出来,主要原因可能还是血浆miR浓度太低,不知楼主有没有做过血浆的miR定量,有没有好的指导方法?跪谢~
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回复:时间:2017-09-02
huangzi1127非常感谢您的回复,神速啊,你的回复很有用,已经摸索一个多月了效果还是不好,有两个目的基因扩增不出来,主要原因可能还是血浆miR浓度太低,不知楼主有没有做过血浆的miR定量,有没有好的指导方法?跪谢~我没有做过血浆中miR
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回复:时间:2017-08-31
seuzsl我没有做过血浆中miR楼主,刚设计遇到麻烦,miR引物序列为:GGUGGCCCGGCCGUGCCUGAGG;由于GC含量太高,无法使Tm值降至60左右,加AT好像要加很多很多,有没有更好的办法?
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