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克隆一个基因,构建好过表达质粒载体,稳定转染细胞,g418筛选稳定克隆,让其在细胞系中过表达,但westernblot显示大部分克隆基因的表达量下降,没有挑出稳定过表达的克隆;
接着做shRNA干扰,交给公司合成了四种shrna质粒,也是打算进行稳定转染,g418筛选,但先做了个瞬时转染预实验,转染换液后48小时收蛋白,westernblot鉴定,发现实验组都比对照高。
请问,有没有大神遇到过这种情况,如果有,可能的原因是什么,有没有解决的方法,有没有相关的文献支持?
谢谢,不胜感激!
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回复:时间:2015-03-17
ccyyatt521谢谢你我之前过表达就是挑单克隆鉴定的,挑了可能有三四十个都没有,师兄说不会有做不出来的过表达,我就是想不明白可能的原因太可怕了挑了三四十也这样。。我是做到扩增单克隆这一步。还没到最后跑western检测呢。前几天将几个pool跑了胶,7个pool只有3个是抬高的。今天不放心又做了3个96孔板。你选的这个细胞应该本来表达也不低吧?所以过表达也不明显。如果瞬时转染甚至加G418筛选之后没有抬高,说明阳性细胞很少很少,这里面有个概率问题,比如说1百个里面只有1个,再加上运气不佳,挑了三四十个克隆没有一个阳性是有可能的。个人感觉。。。质粒序列包括抗性序列和你的目的蛋白序列。转进基因组,有几种可能,一个是两个片段都转进去了两个都开始表达,这是我们想要的阳性细胞;一个是只有抗性序列转进去了抗性序列在表达目的蛋白没有表达,或者说即使目的蛋白转进去了但是它就是不表达(因为对细胞生存不是需要的),这是假阳性,所以才需要挑选。蛮讲运气的感觉。就是说都是假阳性啊。。。
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回复:时间:2015-03-14
展开引用ccyyatt521大家好,最近做实验遇到了很棘手的问题:克隆一个基因,构建好过表达质粒载体,稳定转染细胞,g418筛选稳定克隆,让其在细胞系中过表达,但westernblot显示大部分克隆基因的表达量下降,没有挑出稳定过表达的克隆;接着做shRNA干扰,交给公司合成了四种shrna质粒,也是打算进行稳定转染,g418筛选,但先做了个瞬时转染预实验,转染换液后48小时收蛋白,westernblot鉴定,发现实验组都比对照高。请问,有没有大神遇到过这种情况,如果有,可能的原因是什么,有没有解决的方法,有没有相关的文献支持?谢谢,不胜感激!......武汉维诺赛生物可以提供shRNA表达载体构建服务,价格合理,可保证实验周期与质量,有意可私聊。公司服务网址:http://www.viraltherapy.cn/detail.aspx?node=FZ1&id=907
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