- Synthesis and optical properti...
- Giti 佳通 Comfort SUV520 汽车轮胎 39...
- Estrogenresponsive RING finger...
- Proteintech Group 品牌介绍及代理商/经销商...
- SCHÜSSLER NOVACHEM GMBH, ...
- 装系统出现microsoft corporrtian是什么意...
- 上海勤翔科学仪器有限公司 公司主页
- Athens Research & Technolo...
- 蛋白产物的检测方法(齐一生物)
- 片段分析软件GeneScan v3.7中文操作手册
- 5’核苷酸酶(5’NT)测试盒
- AlphasynucleinandParkinmediate...
- [11-04]抗体封闭和sirna沉默的区别
- [11-08]在trna的二级结构的_RNA典型的二级结构是什么?tRNA的二级结构是...
- [08-14]求助sirna序列比对的问题。_问答详情_寡聚核酸_其他分子产品_...
- [08-09]【求助】shRNA与siRNA的区别 核酸基因技术论坛
- [10-02]siRNA转染成功的主要关键点有什么
- [08-16]siRNA干扰常见问题
- [12-18]tRNA衍生片段和tRNA半分子的生物学功能及其在疾病发生中的作用
- [08-05]【求助】siRNA 基因敲除 细胞技术讨论版
- [11-04]sirna转染后多长时间提rna
GeneScan使用说明医疗文档类资源
1主要试剂
STRPvimer PostiveControlDNA
STRBuffer AlleleLadder
GoldTaqDNAPolymerase Rox-350
2主要仪器
DNA扩增仪(PE9700)
自动测序仪(PE377)
微型高速离心机
GeneScan软件
Geneotyper软化
3操作步骤
3.1基因组DNA提取——盐析法
3.1.1操作流程
用方框图形式,按照GeneScan技术的先后顺序和技术要求、分割形成7个相对独立的实验阶段,以便合理安排分配试验时间,提高工作效经。
3.1.2操作步骤:
①取0.1ml血样置于1.5mlEP管。
③13000rpm离心2分钟,用无菌移液管移弃上清液。
④加TE缓冲液重复②、③步一遍,然后用红细胞裂解缓冲液(RCLB),重复②、③步两遍。
⑤最后一次RCLB洗涤后,移去上清液,加入100μlDSP工作液,充分混匀直至沉淀块碎。
⑥56℃孵育2小时。
⑦95℃孵育10分钟。
3.1.3纯化DNA
①加35μl高氯酸钠,混匀后13000rpm离心5分钟,小心吸取上清液。
②加2.5倍体积冷无水乙醇,沉淀DNA,12000rpm离心8分钟,弃上清液。
③加入1ml70%乙醇洗涤DNA,10000rpm离心7分钟,弃上清液。
④置超净台内自然干燥后,加入100μlddH2O,置4℃保存,待用。
提取基因组DNA 纯化DNA
(盐析法)
DNA定量
扩增
电泳
GeneScan
Genotyper
计算机分析处理
操作流程图
3.2DNA定量
3.2.1配制0.8%琼酯糖凝胶
3.2.2将标准含量(20ng/μl、10ng/μl、5ng/μl)的DNA样品和分子量大小DNA参照物置于干热器孵育5分钟,稍离心。
3.2.3将分子量大小DNA参照物、标准量DNA及待测DNA样本各10μl依次加入胶中。
3.2.4电压150V、电泳30分钟。
3.2.5将胶置于紫外透测仪上,观察结果并照像。
3.2.6与标准量DNA比对,估算并记录样本DNA含量。
3.3基因扩增
反应体系为10μl,其中样本DNA4.0μl,MasterMix6.0μl。
3.3.1根据定量结果将模板DNA量全部调至1ng/μl。
3.3.2配制扩增反应液(MasterMix),(注:在冰上操作)。
STR10×Buffer 4.58μl
STR10×Primer 2.08μl
TaqDNApolymerase(5μ/μl) 0.17μl
以上反应物混合后用8联枪,加至每个样品扩增管中(在冰浴上操作)。
3.3.3将模板DNA4.0μl和已对照DNA4.0μl分别加入已标记好的96孔薄壁扩增管内,混匀后加橡胶垫盖紧管口,置PE9700型扩增仪中。
3.3.4十个位点扩增热循环参数的设置:
最初预变性95℃11min;94℃,1min;59℃1min;72℃,1min共28个循环,最后60℃,延伸45min;4℃保存备用。
3.4电泳
采用美国PE公司制造的377A型自动测序仪进行。
3.4.1预电泳条件:时间20min,功率50W,电流13mA,电压1KV。
3.4.2FLS/G350混合液的配制。
FLS 3.6μl
Rox-350 0.4μl
以上反应液混合后,用8联枪分置在48孔扩增管中。
3.4.3DNA样本处理:将扩增产物用去离子水对倍稀释后取3μl,分别加入标记好有FLS/GS350混合液4μl的扩增管中并混匀。在第1孔和第48孔加入1μlSTR等位基因标记物;第2孔和第47孔为已知对照DNA,第3~46孔为样本DNA,操作全过程均在冰浴上进行;混合物置PE9700扩增仪上进行95℃,5min变性,然后放置冰浴中备用。
3.4.4电泳:按照扩增板上各样本的排列顺序,用8道加样器吸取样本0.8μl加至上样槽中,在第1和48泳道中为Ladder,第2和47泳道为P·C,第3~46泳道为样本DNA。
电泳条件:时间2小时30分钟,功率200W,电流强度60mA,电压30KV。
3.5基因扫描
用GeneScan软件将电泳收集的电泳图谱信息经过电子计算机处理成数据信息。
3.6基因分型
用Genotyper软件,依据数据信息与设计等位基因分子大小标记的内标比较被定义。以美国PE公司的等位基因标准物(AlleleLadder,AL)为参照物进行分型,等位基因按重复次数命名,电泳图谱中不同位点的等位基因显示出不同颜色,同一位点的不同等位基因为同一种颜色,它们的迁移率各不相同。电泳图谱中的颜色分为红、黄、蓝、绿。红色为Genescan-350[ROX],是设计的等位基因分子量大小标记物,在变性条件下产生的片段大小:50、75、100、139、150、160、200、250、300、340、350bp;黄色为NED,标记的基因位点有D5S818,D13S317和D7S820;蓝色为S-FAM,标记的基因位点有D3S1358,VWA和FGA;绿色为JOE,标记的基因位点有Amelogenin,TH01,TOPXtCAF1PO。
================ 蚂蚁淘在线 ================
免责声明:本文仅代表作者个人观点,与本网无关。其创作性以及文中陈述文字和内容未经本站证实,对本文以及其中全部或者部分内容、文字的真实性、完整性、及时性本站不做任何保证或承诺,请读者仅作参考,并请自行核实相关内容
版权声明:未经蚂蚁淘在线授权不得转载、摘编或利用其他方式使用上述作品。已经经本网授权使用作品的,应该授权范围内使用,并注明“来源:蚂蚁淘在线”。违反上述声明者,本网将追究其相关法律责任。