ncRNA与人类疾病biomarker研究相关交流-蚂蚁淘在线

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   非编码RNA（non-codingﾠRNA，ncRNA）主要是指不编码蛋白质但参与基因调控的RNA分子。其在基因转录、基因转录后以及翻译水平发挥重要的调控作用。
    在医学领域，生物标志物（bioMarker）具有诊断价值、预后价值和预测价值。敏感及特异性的生物标志物在未来临床精准医疗中尤为必要，同时也可作为药物设计的潜在靶标。与蛋白质生物标志物相比，RNA生物标志更为敏感和特异，其检测成本也大大低于蛋白质标志物。与DNA生物标志物相比，一个细胞中存在多种RNA，比DNA能提供更多信息，更能动态反映细胞状态和调控过程，一些特殊结构RNA（如环状RNA）有在血浆和/或血清中稳定存在的潜力。
    近年来研究发现，ncRNA中miRNA、lncRNA及circRNA的异常表达与人类许多疾病都相关。重大疾病相关ncRNA机制的探究，以及ncRNAbiomarker的发现给疾病诊断、药物设计等医学研究带来希望。
    我们对于ncRNA中miRNA、lncRNA、circRNA作为不同疾病生物标志物的相关研究进行小结，供您在科研道路上参考。

北京博奥晶典生物技术有限公司ncRNA（人）产品列表

CircRNA与人类疾病biomarker研究
博奥晶典人类环状RNA芯片v2用于冠心病biomarker研究

研究背景

ncRNA作为表现调控的新参与者，在人体内发挥着重要的作用。已有研究表明，LncRNA可作为食管癌、胃癌、肾细胞癌等多种癌症的biomarker，且与多种疾病相关。来自第三军医大学大坪医院曾春雨教授和周林教授课题组的研究者们利用冠心病病人及对照组的血浆及PBMC细胞进行lncRNA芯片的高通量筛选及后续扩大临床样本验证，发现了跟冠心病相关的lncRNAﾠbiomarker。相关结果分别发表在2015年5月的ClinicalScience（IF=5.59）及2016年2月的CardiovascularResearch（IF=5.94）。

研究路线

主要研究结果

筛选差异表达基因
选取15例冠心病及15例健康人的PBMC细胞及血浆样本，通过lncRNA芯片筛选出差异表达的lncRNA，因筛选出的差异基因太多，通过提高筛选标准，来减少差异基因的数量，筛选出5个候选lncRNAbiomarker。

候选差异基因验证

采用与芯片筛选实验相同的样本，对5个候选lncRNA进行qPCR验证，其中4个lncRNA芯片结果与qPCR结果一致。采用qPCR的方法，对4个候选lncRNA在20对独立血浆样本或PBMC中进行验证，实验结果表明：疾病组与正常组都存在着显著差异。通过与临床数据的关联分析表明：lncRNAAC100865.1（命名为：CoroMarker）可以更好的预测CAD风险。

Biomarker敏感性验证
合并其他4种CAD发病相关的风险因素与CoroMarker在血浆样本中的表达水平，可以增加预测的敏感性。运用qPCR检测CoroMarker的表达水平与其他9种心脑血管疾病发病风险分析，结果表明CoroMarker能从其他9种心脑血管疾病中单独区分CAD的发病风险。

参考文献

1.CaiYetal.,Circulating"lncRNAOTTHUMT00000387022"fromMonocytesasaNovelBiomarkerforCoronaryArteryDisease.
CardiovascRes.2016.Feb7.
2.YangYetal.,Plasmalongnon-codingRNA,CoroMarker,anovelbiomarkerfordiagnosisofcoronaryarterydisease.ClinSci(Lond).
2015.Oct1;129(8):675-85.

miRNA与人类疾病biomarker研究
血清miR-1290可作为人类结直肠癌早期检测、复发和预后的新型biomarker

研究背景

miRNA作为许多人类疾病潜的在非侵入性生物标志物而引起人们的兴趣。来自日本Mie大学医学部的研究人员前期利用miRNA芯片对结直肠癌（CRC）病人、结直肠瘤病人及健康对照的血清进行高通量筛选，获得候选miR-1290分子，并通过后续在多个独立验证集（共692份组织／血清样本）中进行分析，认为血清中miR-1290是一个强大且有前途的，可用于早期结肠直肠肿瘤诊断和预后的非侵入性生物标志物。相关结果发表在2016年10月的AnnalsofOncology上（IF=9.269）。

研究路线

主要研究结果

324份血清样本中验证miR-1290可以作为人结直肠癌诊断的biomarker：

1.324份血清样本中miR-1290表达的框式图;

2.ROC曲线分析血清miR-1290区分CRC与健康对照结果：AUC=0.83,敏感性=70.1%；特异性=91.2%（cut-offﾠvalue:0.0000182）；

3.ROC曲线分析血清miR-1290区分结直肠腺瘤患者与健康对照结果：AUC=0.718,敏感性=46.4%；特异性=91.2%（cut-offvalue:0.0000182）；

4.在肿瘤组织中具有高miR-1290表达的CRC患者显示出比具有低miR-1290表达的患者显着差的总生存率(P=0.0082,log-ranktest;cut-offvalue:0.047);

5.在血清中具有高miR-1290表达的CRC患者显示出比具有低miR-1290表达的患者显着差的总生存率（P<0.0001,log-ranktest;cut-offvalue:0.000039)；

6.根据血清标本中miR-1290表达水平的状态，分析II期和III期CRC患者的生存曲线。具有血清miR-1290高表达的患者显示比miR-1290低表达的患者显着更差的总生存率(P=0.039,log-ranktest;cut-offvalue:0.000039).；

7.根据血清标本中miR-1290表达水平的状态分析I-III阶段CRC患者的无病存活率（DFS）。具有血清miR-1290高表达的患者显示比miR-1290低表达的患者显着更差的DFS(P=0.05,log-ranktest;cut-offvalue:0.000039)；

参考文献

H.Imaokaetal.,CirculatingmicroRNA-1290asanoveldiagnosticandprognosticbiomarkerinhumancolorectalcancer,AnnOncol(2016)27(10):1879-1886.(IF=9.269).

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