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批量层析方法筛选 poly (A)+ RNA
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实验方法原理 | 当处理许多RNA样品或处理小量的哺乳动物总RNA时(<50μg),可选择用oligo(dT)—纤维素进行批量层析的方法。这种方法采用级别较好的oligo(dT)—纤维素,在最佳温度进行结合和洗涤。多年来发表了许多纯化poly(A)+RNA的批量层析方法。 |
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实验材料 | 总RNA |
试剂、试剂盒 | 吸附洗涤缓冲液醋酸铵乙醇冰预冷的水NaClTES |
仪器、耗材 | 比色杯微量离心机Oligo(dT)18-30—纤维素旋转轮水浴 |
实验步骤 | 一、材料 1.缓冲液和溶液 吸附/洗涤缓冲液(含0.5mol/LNaCl的TES缓冲液) 醋酸铵(10mol/L) 乙醇 冰预冷的水 NaCl(5mol/L) TES 2.核酸和寡核苷酸 总RNA 3.专用设备 用于测量260nm吸光值的比色杯 有速度控制的微量离心机 Oligo(dT)18-30—纤维素 旋转轮 55℃和65℃的水浴 二、方法 1.在一系列灭菌微量离心管中,将每份总RNA(上限为1mg)样品的体积用TES调整到600μl。封好管口,在65℃加热10min,然后迅速在冰上冷却到0℃。每份样品加75μl(0.1倍体积)5mol/LNaCl。 2.在每管中加50mg(500μl)平衡的oligo(dT)—纤维素,盖好管盖,室温下在旋转轮上温育15min。 3.用微量离心机在室温下离心,600~800g(约1500~2500r/min),2min。 4.将上清移到一系列干净的离心管中,置冰上存放。 5.在含oligo(dT)的沉淀中加1ml冰预冷的吸附/洗涤缓冲液。温和旋涡震荡分散沉淀。将盖好盖子的离心管置于旋转轮上,室温下温育2min。 6.室温下,用微量离心机离心,600~800g(约1500~2500r/min),2min。弃上清。重复步骤5和6两次。 7.在含oligo(dT)的沉淀中加0.4ml冰预冷的双蒸灭菌水,温和旋涡震荡以重悬沉淀。立即在微离心机上离心,4℃,2min。 8.小心吸去上清。 9.回收结合的poly(A)+RNA:用400μl双蒸灭菌水重悬沉淀,在55℃温育5min,然后4℃离心2min。 10.将上清移至一系列干净的离心管中,重复步骤9两次,合并所有上清。 11.在上清中加0.2倍体积的10mol/L醋酸铵和2.5倍体积的乙醇,在-20℃存放30min。 12.回收沉淀的poly(A)+RNA:4℃离心,最大速度,15min。小心弃上清,用70%乙醇洗沉淀,短暂离心,吸去上清,将管盖打开,倒置数分钟,使大部分残留的乙醇挥发。 13.用小体积灭菌的DEPC处理的水溶解RNA。 14.估计RNA浓度。 15.保存样品。 ![]() |
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