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批量层析方法筛选 poly (A)+ RNA

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实验方法原理当处理许多RNA样品或处理小量的哺乳动物总RNA时(<50μg),可选择用oligo(dT)—纤维素进行批量层析的方法。这种方法采用级别较好的oligo(dT)—纤维素,在最佳温度进行结合和洗涤。多年来发表了许多纯化poly(A)+RNA的批量层析方法。
实验材料
试剂、试剂盒
仪器、耗材
实验步骤
一、材料

1.缓冲液和溶液

吸附/洗涤缓冲液(含0.5mol/LNaCl的TES缓冲液)

醋酸铵(10mol/L)

乙醇

冰预冷的水

NaCl(5mol/L)

TES

2.核酸和寡核苷酸

总RNA

3.专用设备

用于测量260nm吸光值的比色杯

有速度控制的微量离心机

Oligo(dT)18-30—纤维素

旋转轮

55℃和65℃的水浴

二、方法

1.在一系列灭菌微量离心管中,将每份总RNA(上限为1mg)样品的体积用TES调整到600μl。封好管口,在65℃加热10min,然后迅速在冰上冷却到0℃。每份样品加75μl(0.1倍体积)5mol/LNaCl。

2.在每管中加50mg(500μl)平衡的oligo(dT)—纤维素,盖好管盖,室温下在旋转轮上温育15min。

3.用微量离心机在室温下离心,600~800g(约1500~2500r/min),2min。

4.将上清移到一系列干净的离心管中,置冰上存放。

5.在含oligo(dT)的沉淀中加1ml冰预冷的吸附/洗涤缓冲液。温和旋涡震荡分散沉淀。将盖好盖子的离心管置于旋转轮上,室温下温育2min。

6.室温下,用微量离心机离心,600~800g(约1500~2500r/min),2min。弃上清。重复步骤5和6两次。

7.在含oligo(dT)的沉淀中加0.4ml冰预冷的双蒸灭菌水,温和旋涡震荡以重悬沉淀。立即在微离心机上离心,4℃,2min。

8.小心吸去上清。

9.回收结合的poly(A)+RNA:用400μl双蒸灭菌水重悬沉淀,在55℃温育5min,然后4℃离心2min。

10.将上清移至一系列干净的离心管中,重复步骤9两次,合并所有上清。

11.在上清中加0.2倍体积的10mol/L醋酸铵和2.5倍体积的乙醇,在-20℃存放30min。

12.回收沉淀的poly(A)+RNA:4℃离心,最大速度,15min。小心弃上清,用70%乙醇洗沉淀,短暂离心,吸去上清,将管盖打开,倒置数分钟,使大部分残留的乙醇挥发。

13.用小体积灭菌的DEPC处理的水溶解RNA。

14.估计RNA浓度。

15.保存样品。

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