限制性内切酶

内切酶PCR反应中的活性

酶切反应条件如下:在20µlPCR产物混合体系中加入5U的内切酶,按相应的反应温度温育1小时。通常20µlPCR产物体系中含有1µg底物DNA,1单位的VentDNA聚合酶,1×ThermoPolBuffer[10mMKCl,20mMTris-HCl(PH8.8@25°C),10mM(NH4)2SO4,2mMMgSO4和0.1%TritonX-100],以及终浓度为200µM的dNTPs。表中标记有*的内切酶在酶切反应前需加入NaCl(终浓度为100mM)或相应的10×NEBuffer(1×终浓度)。

注意:在非最佳条件下进行酶切反应容易出现星号活性。要避免星号活性或希望取得更好的酶切效果,则需用乙醇沉淀纯化DNA,再将其溶解于相应的酶切缓冲液。此外,如果使用不纯的DNA聚合酶,会因其中混有其它核酸酶而影响整个反应结果。

+++表示完全切割;++表示约50%被完全切割;+表示约25%被完全切割。

在反应物中的活性
AATII+++
AccI+
Acc65I++
AciI+++
AclI++
AflII+++
AflIII++
AgeI+++
AhdI++
AluI+++
AlwI++
AlwNI++
ApaI+++
ApaLI+++
ApoI++
AscI+++
AseI+
AvaI+++
AvaII++
AvrII+++
BaeInone
BamHI
+++
BanI+++
BanII+++
BbsI+++
BbvI++
BcgI++
BciVI++
BclI+++
BfaInone
BglI+
BglII+++
BlpI+++
BmrI
+++
BpmI++
BsaI+
BsaAI+++
BsaBI++
BsaHI+++
BsaJI+++
BsaWI++
BseRI+++
BsgI++
BsiEI++
BsiHKAI*++
BsiWI++
BslI++
BsmI+++
BsmBI++
BsmFI++
BsoBI+++
Bsp1286I+++
BspDI++
BspEI*+++
BspHI++
BspMInone
BsrI+++
BsrBI+++
BsrDI++
BsrFI++
BsrGI++
BssHII++
BssKI++
BssSI+++
BstBI+++
BstEI+++
BstNI++
BstUI++
BstXI+++
BstYI++
BstZ17I++
Bsu36I+++
BtgI
+++
BtsI
+++
Cac8I+++
ClaI++
DdeI+++
DpnI(none,requiresmethylatedsubstrate)
DpnII+++
DraI++
DraIII*+++
DrdI++
EaeI+++
EagI+
EarI+++
EcoNI++
EcoO109I+++
EcoRI++
EcoRV+++
Fnu4HI+++
FokInone
FseI+++
FspI++
HaeII+++
HaeIII+++
HgaI+++
HhaI++
HincII++
HindIII+++
HinfI++
HinP1I+++
HpaI+++
HpaII+++
HphI+++
KasI+++
KpnI+++
MboI++
MboII+++
MfeI++
MluI++
MlyI
+++
MnlI+++
MscI++
MseI++
MslI+++
MspI+++
MspA1I+++
MwoI++
NaeI+
NarI++
NciI++
NcoI+++
NdeI++
NgoMIV++
NheI++
NlaIII+++
NlaIV+++
NotI+++
NruI++
NsiI+++
NspI
+++
PaeR7I++
PflFI++
PflMI++
PleI++
PmeI++
PmlI++
PpuMI++
PshAI++
PspGI
++
PstI+++
PvuI++
PvuII+++
RsaI+++
RsrII++
SacI++
SacII+++
SalI*+
SapI++
Sau3AI+++
Sau96I++
ScaI++
ScrFI+++
SexAI
none
SfaNI++
SfcI+++
SfiI+++
SfoI
+++
SgrAI
+++
SmaI++
SmlI+++
SnaBI++
SpeI+++
SphI+++
SspI++
StuI++
StyI++
SwaI
+++
TaqI++
TfiI+++
TliI
+++
TseI+++
Tsp45I+++
Tsp509I+++
TspRI++
Tth111I++
XbaI+++
XcmI+++
XhoI++
XmaI++
XmnI+++

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