RNA提取纯化试剂

野生型杆状病毒的纯化实验一基本方案

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实验材料
试剂、试剂盒
仪器、耗材
实验步骤
1. 以每1.8×107细胞的密度接种Sf9细胞于至少10个150cm培养瓶中。27℃温育约2h,让细胞牢固贴壁,以0.1的感染复数用野生型AcMNPV感染。当观察到多数细胞中含有包涵体时,将病毒上清(约200ml)转移至4个50ml锥形管中。
 
2. 4℃1000g离心10min,将病毒上清倒入4个新的管子中。重复离心以去除所有残留细胞。
 
3. 将病毒上清置于SW-27超离心管中,平衡后于4℃,100000g离心30min,收集病毒。倾倒出上清,将管子倒扣于Kimwipe纸巾上,尽可能倒干液体。

4. 仔细检査病毒沉淀块,如果病毒沉淀较纯(应该是不透明、发白的外观),则转至步骤10继续进行。多数情况下,病毒沉淀块由于有细胞碎片的存在而会发黄。如果是这种情况,则用下列两种方法中的一种从细胞残序物中分离出病毒。
 
用蔗糖梯度分离纯化病毒团块:
 
5a. 加入1ml0.1×TE缓冲液,反复上下吹打重悬病毒沉淀。如果沉淀难以重悬,则于4℃温育过夜。

6a. 用溶于0.1×TE缓冲液中经过滤除菌的超纯蔗糖制备两份从25%到56%蔗糖线性梯度液,置于超离心管中。

7a. 仔细将0.5ml病毒悬液铺至每一蔗糖梯度液的顶部,4℃100000g离心90min。

8a. 用巴斯德吸管将病毒带转移至SW-41超离心管中,管的上部加入0.1×TE缓冲液。

9a. 于4℃100000g离心30min,收集病毒,弃上清,倒扣离心管于Kimwipe纸巾上,尽可能倒干液体。
 
微量离心纯化病毒沉淀块:
 
5b. 加入3ml抽提缓冲液,反复上下吹打重悬病毒沉淀。如果难以重悬,则于4℃温育过夜。
 
6b. 分别转移1.5ml病毒悬液于两个1.5ml微量离心管中。最大速度下微量离心5min,上清转移至一个15ml聚苯乙烯离心管中。

7b. 用1ml抽提缓冲液重悬每一团块,冼涤。
 
8b. 在最大速度下微量离心5min,将两份上清与15ml聚丙烯管中的上清液合并。

9b. 用抽提缓冲液补足至9ml,分成4.5ml的两小份移至2个15ml聚丙烯离心管中。转至步骤11继续。
 
10. 用9ml抽提缓冲液重悬沉淀,分成4.5ml的两小份移至2个15ml聚丙烯离心管中。

11. 每管分别加入200μg10mg/ml蛋白酶K,50℃保温1~2h。
 
12. 每管各加入0.5ml10%N-十二烷基肌氨酸钠,50℃温育2h或过夜。
 
13. 用等体积的25:24:1的酚/氯仿/异戊醇抽提DNA两次。
 
14. 用一宽嘴(5~10ml)吸管将含有DNA的水相转移至另一个15ml聚丙烯管中。加10ml100%的乙醇,倒转离心管数次,轻柔混合,于-80℃放置10min。

15. 于4℃,1500g在台式离心机中离心20min,弃上清,以70%乙醇洗涤DNA沉淀,风干30~60min。加入800μl1×TE缓冲液重悬沉淀。 

16. 各取400μl移至两个微量离心管中,每管中加入40μl3.0mol/l乙酸钠和2倍体积的100%乙醇重新沉淀DNA放置10min。

17. 微量离心10min。弃上清。用70%乙醇洗涤DNA沉淀并冻干,用0.3~1ml1×TE缓冲液重悬DNA。测260nm吸光值并计算产量。DNA保存于4℃。