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用随机寡核苷酸引物从mRNA合成cDNA探针
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实验方法原理 | 本方案以poly(A)+RNA作为模板,通过随机引物反应合成CDNA探针,这类探针可用于cDNA文库的差异筛选。 |
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实验材料 | |
试剂、试剂盒 | 乙酸铵DTTEDTA乙醇HClNaOH酚氯仿胰RNA酶抑制剂SDSTris-CldNTP溶液 |
仪器、耗材 | 冰水浴SephadexG-50离心柱水浴或加热板 |
实验步骤 | 一、材料 1.缓冲液与溶液 乙酸铵(10mol/L) DTT(1mol/L) EDTA(0.5mol/L,pH8.0) 乙醇 HCl(2.5mol/L) NaOH(3mol/L) 酚:氯仿(1:1,V/V) 胰RNA酶抑制剂(20单位/μl) SDS(10%m/V) Tris-Cl(1mol/L,pH7.4) 2.酶和缓冲液 反转录酶 10X反转录酶缓冲液 3.核酸与寡核苷酸 含有dATP、dGTP和dTTP各20mmol/L的dNTP溶液 dCTP(125μmol/L) 长度为六或七个碱基的随机脱氧核苷酸引物 模板mRNA 4.放射性化合物 [α-32P]dCTP(10mCi/ml,比活性为>3000Ci/mmol) 5.专用设备 冰水浴 SephadexG-50离心柱,平衡于TE(pH7.6) 预热至45℃、68℃和70℃的水浴或加热板 二、方法 1.将1μgpoly(A)+RNA转移至消毒的微量离心管。用无RNA酶的水将溶液的体积调至4μl。盖紧微量离心管盖,于70℃加热5min,然后迅速将离心管转至冰水浴中。 2.在微量离心管的冷溶液中加入: 10mmol/LDTT 2.5μl 胎盘RNA酶抑制剂 20单位 随机脱氧寡核苷酸引物 5μl 10X反转录缓冲液 2.5μl 20mmol/LdGTP、dATP和dTTP溶液 1μl 125μmol/LdCTP溶液 1μl 10mCi/ml[α-32P]dCTP (比活性为>3000Ci/mmol) 10μl 无RNA酶的水 加至24μl 反转录酶(200单位) 1μl 3.加入下列试剂以终止反应: 0.5mol/LEDTA(pH8.0) 1μl 10%(m/V)SDS 1μl 充分混合管中的试剂。 4.在反应管中加入3μl3mol/LNaOH,68℃温育混合物30min以水解RNA。 5.使反应混合物的温度冷却至室温,加入10μl1mol/LTris-Cl(pH7.4)以中和溶液,混匀,然后加入3μl2.5mol/LHCl。取极小量液体滴在pH试纸上,以检测溶液的pH。 6.用酚:氯仿抽提纯化cDNA。 7.用离心柱层析或在2.5moI/L醋酸铵存在下用乙醇选择性地沉淀放射性标记的探针以与未掺入的dNTP分离。 8.用三氯乙酸(TCA)沉淀法或DE-81滤膜结合法来确定放射性标记dNTP掺入的比例。 |