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PCR技术的原理与方法(3)
PCR常见问题一.没有扩增产物1.循环温度:变性温度、退火温度2.引物设计3.DNA聚合酶活性4.抑制性成份(蛋白酶、核酸酶、其它抑制聚合酶活性的成份)5、DNA样品二.非特异产物及电泳呈涂布状1.Mg2浓度2.调整引物、模板、聚合酶的用量3.适当减少循环数4.适当提高退火温度,缩短退火或延伸时间 PCR相关技术一.锚定PCR(anchoredPCR):•引进锚定引物,可以帮助克服序列未知或序列未全知的障碍。•在DNA3’-末端加上poly(dG)尾,与此相对应的锚定引物poly(dC)一般应在十二聚以上。二.不对称PCR(asymmetricPCR)不对称PCR主要是在PCR体系中设计不同的引物浓度,两条引物浓度比为1:50或1:100,前12个循环两条模板等量扩增,之后低浓度引物消耗殆尽,其扩增产物减少以至于无;而高浓度引物介导产生的扩增产物(即单链DNA)逐渐增加,可得到大量单链DNA(ssDNA)用于直接测序。三.反向PCR(inversePCR) 四.多重PCR(multiplexPCR)多重PCR是用多对引物同时对模板DNA上的多个区域进行扩增。多重PCR技术的难点不是在于其原理和操作的复杂性,而是在于其多对引物的设计,必需保证多对引物之间不形成引物二聚体,引物与目标模板区域具有高度特异性。应用于基因诊断,对与疾病相关的基因(庞大)进行扩增检测。 五.逆转录PCR(reversetranscriptionPCR,RT-PCR)•由mRNA逆转录产生CDNA链作为PCR反应模板。•逆转录合成cDNA时,引物可选用特异引物、随机六聚体引物或寡聚dT(12-18)。•设计RT-PCR的引物时最好是分散在不同的外显子上,以免基因组DNA的污染导致假阳性结果 七.原位PCR(InsituPCR)原位PCR是指在组织或细胞标本片上直接进行PCR,对细胞中的靶DNA进行扩增,通过掺入标记基团直接显色或结合原位杂交进行检测的方法。可分为直接法和间接法。基本步骤:组织切片或细胞固定→蛋白酶消化→原位PCR扩增→冲洗→产物检测优点:灵敏度高,可进行细胞内定位八.荧光定量PCR(FQ-PCR)荧光定量PCR:融汇PCR技术、DNA探针杂交技术(标记有荧光报告基团和荧光淬灭基团),结合先进的光谱检测技术发展起来的一项新技术。主要原理是在待扩增区域结合上DNA探针,PCR过程中,具有5’→3’外切酶活性的Taq酶延伸引物链到DNA探针时,将DNA探针逐个降解,释放出荧光报告基团,这样PCR体系中荧光的强度与PCR产物量之间存在正比关系,可通过测定荧光强度而对PCR产物定量。 PCR技术的应用1.遗传性疾病的基因诊断2.传染病的诊断(肝炎病毒)3.癌基因检测4.法医学(亲子鉴定)上的应用5.DNA测序6.基因克隆7.引入基因点突变,基因融合等
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