破碎混匀

2009-07-26【求助】超声处理细胞/细菌样品破碎DNA是否合理?

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加loADIngbuffer裂解细胞/细菌以后,样品里面的DNA会和SDS形成一团东西,无法直接上样

平常都是用超声破清洗器水浴超声破碎大约20分钟,然后上样的

但是一方面,常温超声不知道会不会造成蛋白降解破坏,因为发现加冰以后超声会变得非常弱,所以都么加冰。另一方面,因为水浴超声声强是不均匀的,如果样品多的话,会发现有些已经超碎DNA,但有些还是一团。

不知道是否有其他更好的方法?
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回复:时间:2009-07-27

顶一下

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回复:时间:2009-07-28

我们的做法是取个2ml的EP管,挑点菌,加入PBS混匀后,用超声波破碎仪冰水浴破菌(注意不是清洗机)个30-40次,再取样加loADIngbuffer电泳。不过前提是要有那种很小超声探头的超声仪。另外可选的就是加点DNA降解酶了。

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回复:时间:2009-07-27

嗬嗬,多谢你的意见~