1.特异性

FQ-PCR具有引物和探针的双重特异性，故与传统的PCR相比，特异性大为提高。

2.敏感性

FQ-PCR的敏感度通常达100拷贝/ml，且线性范围很宽，为0-1011拷贝/ml。-般来讲，临床标木中病原体的数目为0-1010/拷贝，在此范围内FQ-PCR定量较为准确，标木不需稀释。

3.重复性

FQ-PCR结果相当稳定，同-标木的CT值相同，但其产物的荧光量却相差甚大。因为域值设置在指数扩增期，在此阶段，各反应组分浓度相对稳定，没有副作用，CT与荧光信号的对数旱线性关系。而当PCR反应进入平台期后，由于反应体系各组分的耗尽、酶活性的降低及产物的反馈抑制等原因导致产物不再增加。与终点法相比CT值能更稳定、更精确地反映起始模板的拷贝数。同时，因PCR是对原始待测核酸模板的-个扩增过程，任何十扰PCR指数扩增的因素如扩增孔间温度差异、标木中DNA聚合酶抑制剂的存在、加样的差异、待测标木中核酸模板的量等，都会影响扩增产物的量，因此，在扩增产物的数量与起始模板数量之间没有-个固定的比例关系，通过检测核酸产物很难对原始模板准确定量。

4.降低产物污染的风险