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蚂蚁淘产品库:Paragon Genomics/816006/ CleanPlex™ 测序文库制备试剂盒
基因检测是整个精准医学的基础,来自美国硅谷的ParagonGenomics正是一家致力于突破目前基因检测领域靶向测序准确度及覆盖率低、成本高及时间长等瓶颈的生命科技公司。
公司开发的超高多重PCR生物试剂平台技术CleanPlex,能使得二代测序靶向基因文库制备的速度比市场上现有方法快5-10倍,并且更加灵敏和准确。
CleanPlex的另外一个明显优势是其所需的样本量只有1-10纳克,对于一些DNA量本身就少的样本(比如细针穿刺活检样本、液态活检样本等)尤为重要。而现有技术一般至少需要高达50ng的DNA样本。
据介绍,CleanPlex技术主要由三个部分组成:超高且均一的多重PCR试剂系统,快速高效的PCR背景清除技术,和高度精确且可扩展的NGS面板设计软件。多重PCR试剂系统确保多达4000个DNA片段可以在同一个PCR反应管中被均匀地扩增。
PCR背景清除技术可以有效并迅速地去除非特异性PCR产物。NGS面板设计软件能够为客户设计并优化得到高效率、高专一性和高均一性的靶向测序面板。
下面是CleanPlex™针对Illumina测序仪的一个典型的工作流程:
下面是一个由CleanPlex制备,包含4000个PCR反应的DNA文库在Bioanalyzer上的DNA片段质检图。标记35和10380上的峰为参照DNA。图中可以看出经过CleanPlex制备的文库非常干净,背景噪音非常小。这对于检测低频变异体(特别是液态活检方面的应用)具有独特优势。
基于CleanPlex,ParagonGenomics已经开发出一整套二代测序靶向基因文库制备解决方案及产品。CleanPlex文库制备试剂盒与其独特设计的引物面板(定制或者目录面板)共同使用时,具有快速简便、高均一性、高覆盖率等特点。因为CleanPlex使用的引物无需做任何化学修饰,其合成成本也可以比其他方法低4-6倍。下面是CleanPlex的主要特点。
今年七月份公司正式发布其二代测序文库制备试剂盒、面板设计服务和一个基于CleanPlex的热点癌症面板。公司希望凭借CleanPlex及强大的靶向测序面板设计能力,成为精准医疗领域的“安卓”,为科研机构、第三方检验所及广大NGS应用开发商提供定制或通用的靶向测序面板及应用系统,共同开发千亿级的无创产前诊断及筛查、癌症诊断、液态活检、遗传病检测及个体化用药指导等广阔市场。