Addgene所述Ç ircular p ermutation基于˚F luorescence ř esonance Ë NERGY 吨转让(BOT)(cpFRET)生物传感器工具包是用于产生和/或遗传编码,单分子FRET传感器,用于比例测量的优化的载体文库。该工具包旨在简化和加速生物传感器的生产,面向对信号转导过程的时空分析感兴趣的广大社区。
cpFRET试剂盒的标志是影响FRET效率的参数的变化:荧光团之间的距离由不同长度的接头修饰,而荧光团的偶极子方向则通过在mTFP1供体和金星受体荧光团中引入的圆形排列来操纵。另外,可以使用不同的感测模块拓扑来进一步增强几何多样性。这也使得能够容纳需要天然N或C末端用于脂质修饰的信号传导分子。
这个基于pTriEx的库由两个设计组成,每个设计包含25个生物传感器。pTriEx载体系统可在大肠杆菌,昆虫和脊椎动物细胞中表达生物传感器。在一种设计中,将野生型(wt)mTFP1荧光团及其四个圆形排列与野生型金星荧光团及其四个圆形排列组合在一起。
设计1生物传感器根据外部荧光团构建:mTFP1(wt和cp变体)后接脯氨酸导向的WW磷酸结合结构域,72个氨基酸(aa)甘氨酸接头,10个氨基酸的ERK底物肽Cdc25C,一个四氨基酸ERK对接位点,金星(wt和cp变体)和一个核出口信号(图1A)。设计2传感器是根据荧光团内部结构构建的:WW域后是mTFP1(wt和cp变体),20 aa接头,金星(wt和cp变体),Cdc25C底物肽,ERK对接位点和核出口信号(图1B)。通过简单的域交换生成设计3和4可以生成两个其他设计,它们显示了混合结构,其中荧光团与传感模块组件交替出现(图1C)。
为了生产新的生物传感器或优化已经存在的生物传感器,可以通过选择的新传感模块交换WW域和ERK底物/ ERK对接肽。可以去除核出口信号以构造核报告仪。此外,荧光团也可以被取代,以利用新的供体/受体组合。由于独特的限制位点位于生物传感器模块中所有组件的两侧,因此简化了克隆过程。用感兴趣的传感模块生产了一个新的文库后,可以使用一种表现出稳定的生物传感器ON和OFF状态的检测方法筛选整个文库,以鉴定具有最高动态范围和最理想的光谱特性的传感器。