Pyreneispolycyclicaromatichydrocarbonwhichiswell-knownforitsABIlitytointercalateintoDNA.Pyrenefeaturesintensebluefluorescence.Itsparametersdependstronglyonfluorophoremicroenvironment.Therefore,fluorescencespectraofpyreneareusedfortheextractionofstructuralinformationaboutsitesurroundingpyrene.Twopyrenesincloseproximityusuallyformexcimerseasilydetectablebyexcimerfluorescence.PyrenecanalsobeaFRETdonortootherfluorophoressuchasperylene.

Withthisphosphoramidite,pyrenecanbeintroducedintoDNAbymeansofautomatedsynthesis.Thispyrenephosphoramiditecontainshydrocarbonmoietyrigidlyattachedtodeoxyuridine.Thisreagentallowstoattachpyrenefragmentto5",internal,or3"position(usinguniversalsupport).

Thisamiditerequiresnospecialhandling,coupling,ordeprotectionconditions.Recommendeddiluentforitisacetonitrile.

Generalproperties

Appearance:	yellowishfoam
Molecularweight:	955.04
Molecularformula:	C57H55N4O8P
Solubility:	goodindichloromethaneandacetonitrile
Qualitycontrol:	NMR1H(95%),31P,HPLC-MS
Storageconditions:	Storage:24monthsafterreceivalat-20°Cinthedark.Transportation:atroomtemperatureforupto3weeks.Avoidprolongedexposuretolight.Desiccate.

Spectralproperties

Excitationmaximum,nm:	260;282;365;392
ε,L⋅mol−1⋅cm−1:	12600;21900;16000;14200
Emissionmaximum,nm:	460
Fluorescencequantumyield:	~0.1

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