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Ex/Em(nm)	None/None
MW	608.15
CAS#	N/A
Solvent	Water
Storage	F/D/L
Category	NucleicAcidDetection RNADetection
Related	Polymerases BiochemicalAssays

Theamine-modifieddeoxycytidine5"-triphosphates(suchas5-propargylamino-2"-deoxycytidine-5"-triphosphate)canbeusedtoproduceamine-containingDNAbyconventionalenzymaticincorporationmethodssuchasreversetranscription,nicktranslation,randomprimedlabeling,orPCR.AminopropargyldCTPcanbereADIlyincorporatedintoDNAthroughtheconventionalenzymaticincorporationtechniques.Theresultingamine-modifiednucleicacidscanthenbelabeledusinganyofamine-reactivefluorescentdyes,biotinsandotheramine-reactivereagents.Theaminopropargyl-modifiednucleotidescanbeincorporatedtoextremelyhighandconsistentlevelscomparedtothetag-labelednucleotidesthatgenerallyhavehigherstereo-hindrance.Subsequentreactionoftheamine-modifiednucleicacidwithanexcessofamine-reactivereagentachievescorrespondinglyhighandconsistentlabelingefficiencies,regardlessofthelabelingreagentchosen.Thistwo-steplabelingmethodalsoeliminatestheneedtooptimizeanenzymaticreactiontoaccommodatedifferentdye-modifiednucleotides,whichmayincorporateatverydifferentrates.ThislabelingmethodiswidelyusedforbothFISHprobesandmicroarray-basedexperiments.

References&Citations

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