- 传染性造血器官坏死病毒(IHNV)核酸检测试剂盒(RTPCR...
- 禽流感病毒H7亚型(AIVH7)核酸检测试剂盒(RTPCR法...
- 核酸检测革命:可替代PCR的犀利技术_郑凌
- 一种基于CRISPR/Cas12a的特异性HPV核酸检测方法
- 核酸检测的一场革命,可替代PCR的犀利技术
- 转基因玉米品系98140核酸检测试剂盒(PCR荧光探针法)_...
- 人鼻病毒(HRV)荧光定量PCR核酸检测试剂盒_荧光PCR试...
- 甲型流感病毒H1亚型(IAVH1)核酸检测试剂盒(PCR荧光...
- 玉米内源基因IVR检测试剂盒(PCR法)
- 核酸检测专用采血管
- 对虾肝胰腺细小病毒(HPV)核酸检测试剂盒(恒温荧光法)说明...
- 牛结节疹病毒(LSDV)荧光PCR核酸检测试剂盒_荧光PCR...
CRISPR重磅新应用,核酸检测灵敏度可达单分子
知名华人科学家张锋教授与同事在《科学》杂志上发表论文,介绍了一种全新的CRISPR应用工具,用以检测核酸。这一工具能快速检测RNA或DNA分子,灵敏度甚至有望检测出单个核酸。这一重磅研究对于科研与全球公共卫生有着极大的影响。
早在2010年,科学家们就意识到,CRISPR平台也许能被用来检测病毒的核酸。但在当时,它的基因编辑潜力过于出众,光芒在一定程度上掩盖了其他领域应用的可能性。直到CRISPR-Cas9基因编辑技术趋于完善之时,科研人员才有余力检视它在病毒检测上的潜力。
科学家们在今日发表的这个系统与CRISPR-Cas9系统有着本质上的差异。它由向导RNA(gRNA)和Cas13a蛋白等部分组成。向导RNA能带领Cas13a蛋白识别并剪开带有特异序列的RNA。然而Cas13a有一个奇怪的特点,当它切开特异的RNA后,就无法管住自己的“双手”,开始疯狂切开它能遇到的任何RNA。利用这一特性,张锋教授与JamesCollins教授在这套系统里塞入了一种带有RNA的荧光标志物。平时它不会发出荧光,但一旦Cas13a到处“搞事情”,这种荧光标志物的RNA就会被切开,让它发出明亮的光芒。
也就是说,只要设计好合适的向导RNA,并提供Cas13a与荧光标志物,那么一旦这套系统识别到匹配的RNA序列,就会发出荧光,告诉研究人员“我们找到了!”
这套系统的灵敏度达到了50fM(1fM为10的负15次方摩尔每升)。
尽管和之前的一些研究相比,它的灵敏度提高了数百万倍,但研究人员依然没有满足。他们想要把灵敏度进一步提高,增加到阿摩尔级(aM,10的负18次方摩尔每升)。为了达到这一目标,他们又用上了“等温扩增”(isothermalamplification)技术,进一步降低了对初始核酸浓度的需求。
在后续的实验中,研究人员发现,使用“等温扩增”技术的这套CRISPR系统无论是对RNA还是DNA,灵敏度都达到了单分子级。
这种不遗漏任何线索的特性让研究人员想到了福尔摩斯(SherlockHolmes)。于是他们杜撰了一个名字,把这套系统称为SHERLOCK(SpecificHighSensitivityEnzymaticReporterUnLOCKing)。
这套系统开发出来可不是为了好玩。研究人员相信,它能用于各种疾病的检测。首先,研究人员在不同的病毒上测试了它的特异性。实验表明,它能很好地区分两种很类似的寨卡病毒株。这对于准确诊断病情,有效预防疫情爆发而言,有着现实的应用价值。
随后,研究人员又开始将它用于检测癌症突变。在癌症的早期诊断领域,液体活检是一大热门——科学家们希望从血液中分离出专属于癌细胞的突变,从而得知癌症是否开始发作。然而,由于血液中有着大量的非癌细胞DNA,这一检测过程也是困难无比。在今日发表的论文中,研究团队使用现成的样本,来模拟患者的血液。而实验表明,SHERLOCK同样能以阿摩尔级的灵敏度,识别出肿瘤特有的突变。
类似的应用还有很多。比如,研究人员用这套系统,成功地鉴定出了人类基因组中的多个单核苷酸多态性(SNP),并能分析出每一个人的特定SNP是纯合还是杂合。在这个基因组的时代,SHERLOCK能得到很广泛的应用。
“能将Cas13a应用到灵敏度如此非同寻常的工具中,我感到非常激动。无论对科学还是临床医学,它都是很强大的工具。”张锋教授说。
“我们现在能有效地制作针对任何核酸的探测器,在诊断或研究领域的应用上,这项工具无比强大,”该研究的另一名资深作者JamesCollins教授说道:“这项工具能在患者的血液中寻找到极少量的肿瘤DNA,帮助研究人员理解肿瘤的突变如何随着时间推移发生改变。另外在公共卫生领域,它也能帮助研究者监控耐药菌的发生频率。科学上它有无限让人激动的可能。”
我们祝贺张锋教授与他的同事们取得的又一突破,并期待看到CRISPR相关技术能给我们带来更多的惊喜。
参考资料:
[1]NucleicaciddetectionwithCRISPR-Cas13a/C2c2
[2]NewCRISPRtoolcandetecttinyamountsofviruses
[3]ScientistsunveilCRISPR-baseddiagnosticplatform
来源:学术经纬
================ 蚂蚁淘在线 ================
免责声明:本文仅代表作者个人观点,与本网无关。其创作性以及文中陈述文字和内容未经本站证实,对本文以及其中全部或者部分内容、文字的真实性、完整性、及时性本站不做任何保证或承诺,请读者仅作参考,并请自行核实相关内容
版权声明:未经蚂蚁淘在线授权不得转载、摘编或利用其他方式使用上述作品。已经经本网授权使用作品的,应该授权范围内使用,并注明“来源:蚂蚁淘在线”。违反上述声明者,本网将追究其相关法律责任。