CRISPR基因敲除

2017-10-29用cas9基因敲除不同转录本怎么设计grna

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回复:时间:2017-10-30

这要具体分析,如果这个基因存在可变剪接,那就看这个基因是否有外显子(不为三的整倍数的外显子)是这些转录本里共有的,如果是就可以在这个外显子上设计sgRNA,这样就可以敲除掉这个外显子和其后的外显子(因为移码突变导致的提前翻译终止)。如果没有这样的外显子那就只能在不同的外显子上设计多条sgRNA,然后筛选这几个转录本都敲除成功的细胞系或实验动物就可以了(毕竟应用Cas9技术能够实现多基因敲除)。