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cDNA文库组标准流程二:mRNA的分离 - cDNA文库 - 资讯 - 蚂蚁淘

作者: 时间:2024-09-20 点击量:

准备工作:1.将Oligotex Suspension 置于37℃水浴中,旋转混匀,溶解Oligotex.,然后置于室温。2.将OBB Buffer置于37℃水浴中,旋转混匀,重溶沉淀物,然后置于室温。3.将OEB Buffer 置于70℃水浴中,待用。试验步骤: 表3:加入试剂量据此表1. Total RNA 量不要多于1mg,用移液器取出所需RNA量到1.5ml离心管中,加RNase-free water 补足到500ul2. 根据表3加入适当体积的OBB Buffer和Oligotex Suspension, 轻弹1.5ml离心管彻底混匀3. 置于70℃水浴中3min4. 取出置于室温(20℃-30℃)10min5. 13000rpm室温离心 2min,用移液器吸出上清到一个新的1.5ml离心管中,保留上清直到polyA被结合上。6. 用移液器取400ul OW2 Buffer混匀沉淀物,将混合物转移到 Spin Column中,RT ,13000rpm,离心1min7. 将Spin Column 转移到一个新的1.5ml离心管中,加400ul OW2,RT, 13000rpm,离心1min8. 将Spin Column 转移到一个新的1.5ml管中,取出25ulOER Buffer(70℃)到Column中,用移液器吹打3-4次树脂,室温 13000rpm,离心1min。9. 取出25ul OER Buffer(70℃)到Column中,用移液器吹打3-4次树脂,室温 13000rpm,离心1min。10. 测OD,并电泳定量。2.磁珠法分离mRNA1. 在RNase-free的Eppendorf 管中加入0.1~1.0mg的总RNA和RNase-free水至终体积为500ul.2. 65 C加热10分钟。3. 加入3ul生物素标记的Oligo(dT)和13ul 20×SSC于RNA中,轻轻混合,室温放置逐渐冷去至室温,一般需10 分钟左右。4. 同时配0.5×SSC 1.2ml和0.1×SSC 1.4ml.5. 将磁珠(SA-PMPs)轻晃散开,放入磁性分离架上,使SA-PMPs集中于管的一侧(约30sec),小心去上清,切不可离心。用0.3ml 0.5×ssc漂洗SA-PMPs,用磁性分离架集中磁珠,去除上清,重复3次。6. 将漂洗后的SA-PMPs重新悬浮于0.1ml 0.5Xssc,注意漂洗后的SA-PMPs应在30分钟内使用。7. 将(3)中的oligo(dT)/mRNA退火反应物全部加入含漂洗好的SA—PMPs管中,轻轻摇匀,室温下放10 分钟。8. 用磁性分离架捕获SA-PMPs,小心去上清,但不要弃去。9. 用0.1×SSC,每次0.3ml洗3次,每次都晃至SA-PMPs悬浮,最后一次漂洗后尽可能多的吸取水相,而不损坏SA-PMPs.10.将SA-PMPs重新悬浮在0.1ml RNase-free水中,反复颠倒,使SA-PMPs散开,洗脱mRNA。11.用磁性分离架捕获SA-PMPs,将洗脱的mRNA吸入另一个新的Eppendorf管中。12.将SA-PMPs再悬浮于0.15ml RNase-free的水中,洗脱,与(11)步洗脱液合并。13.将得到的mRNA溶液取几微升跑电泳,若mRNA浓度不足以进行下一步的反转录,则需将得到的mRNA溶液浓缩(浓缩步骤见14-18)。14.加0.1体积的3mol/l NaAc和1.0体积的异丙醇于洗脱液中,-20 C沉淀过夜。15.4 C,13000g离心60 分钟。去上清,加入500ul 70%乙醇混匀。16.4 C,7500g离心10 分钟。17.去上清,真空或空气中自然风干,但不要太干,加适量RNase-free水溶解。18.重复步骤5-12,将步骤8保留下的样品重新上柱注意事项:1.所有操作均需要严格戴手套,戴口罩进行2.如果total RNA质量高,杂质少,就选择Oligotex的方法分离mRNA,相反则可以用磁珠法。3.mRNA的电泳图是smear。

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