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제품특징
EpiXplore Methylated DNA Enrichment Kit는 전체 genome의 hypo- & hyper-methylated DNA 모두를 enriching과 fractionating 하기 위한 간단한 magnetic bead 기반의 방법이다. (Figure 1)
Enrichment는 sequencing 동안의 background를 감소시킴으로 유전자 조절 연구에 있어 최상의 결과를 가져다준다. (1)
□ EpiXplore Methylated Enrichment Kit를 선택해야 하는 이유
EpiXplore protocol은 methylated DNA와 특이성이 높은 Methylated DNA Binding (MDB) 단백질 사이의 affinity binding에 기반을 두고 있다.
● 어떠한 antibody도 필요하지 않고 이후의 immunoprecipitation (IP) 절차가 요구되지 않는다.
● 유연한 프로토콜은 (methylation 밀도차에 의한) fraction이나 한 번의 fraction으로도 methylated DNA를 elute하도록
해준다.
일반적인 IP-기반의 enrichment 방법 (MeDIP & MCIp)은 유연함이 부족하기 때문에 필요한 전처리과정을 행하면서 시작 물질의 감소가 발생한다. 좀 더 중요한 점은, MeDIP & MCIp은 methylated DNA의 gradient 분리가 이루어지지 않는다는 점이다.
□ 왜 methylation 밀도에 의해 분리해야 하는가?
최근의 연구로 낮은 밀도의 methylation에 medium가 있는 genome 부분이 변화가 생기는 유전자 조절에서 중요한 역할을 한다는 것이 보고되고 있다. (2-4) EpiXplore Methylated DNA Enrichment Kit만이 enriched methylated DNA가 methylation 밀도에 기반을 둔 3개의 fraction으로 나누어지는 elution buffer를 포함하고 있다.
□ Applications
● Mapping methylation sites
● Methylation-sensitive restriction enzyme-based assays
● Real time and endpoint PCR assays
● Bisulfite sequencing
● Library preparation for high-throughput sequencing
● Sample prep for DNA microarray analysis
