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蛋白质组学技术助力外泌体研究

作者: 时间:2024-11-14 点击量:

\"\"2013 年诺贝尔生理学或医学奖表彰了三位发现细胞内部囊泡(外泌体)的运输调控机制的科学家,使得外泌体称为科研界一颗闪耀的新星,对于外泌体领域的研究也是一路高歌,如火如荼。那什么是外泌体呢?外泌体,英文名叫 Exosomes,是一种能被机体内大多数细胞分泌的直径大约为 30~150 nm 的具有脂质双层膜的微小膜泡,包含了复杂 RNA 和蛋白质的小膜泡,它天然存在于体液中,包括血液、唾液、尿液和母乳等,而不同组织来源的外泌体在内容物组成和功能方面存在差异,同时这种差异受到细胞外基质和微环境的动态调控。外泌体研究是医学研究中非常重要的一个方面,生物标志物、免疫调控、干细胞等均是外泌体研究的热门方向。而基于质谱的蛋白质组学是研究外泌体不可或缺的一项技术,Nature、Oncogene、PNAS 等国际专业学术杂志也分别报道了外泌体蛋白质组学,在疾病的生物标记物筛选、代谢疾病研究、肿瘤转移机制、免疫调控等领域的相关研究进展。 \"\"案例分享:1. Nature:外泌体蛋白 PD-L1---抗肿瘤免疫反应作者不仅发现来自人类黑色素瘤细胞的外泌体也携带着 PD-L1 蛋白,可直接结合 T 细胞并抑制其功能,还发现乳腺癌和肺癌的外泌体中也携带有 PD-L1 蛋白,以颠覆现有观念的震撼模式展示了癌症抑制免疫系统的系统性方法。Gang Chen, et al. (2018) Exosomal PD-L1 contributes to immunosuppression and is associated with anti-PD-1 response \"\"2. J Exp Clin Cancer Res:外泌体蛋白 THBS1 促进口腔鳞状细胞癌的恶性迁移作者收集了正常口腔上皮细胞,口腔粘膜白斑细胞和口腔鳞状细胞癌(OSCC)细胞条件培养基和外泌体上清液。通过质谱蛋白质组学、蛋白质印迹、酶联免疫吸附测定和生物信息学分析,探讨了 OSCC 发展过程中巨噬细胞的表型改变潜在的机制。Xiao, M., et al. (2018) M1-like tumor-associated macrophages activated by exosome-transferred THBS1 promote malignant migration in oral squamous cell carcinoma.  \"\" 3. PNAS:蛋白组学揭示糖尿病中内皮功能障碍的新机制研究者利用高效的外泌体分离方法,分别分离了 CCA、PSC,和 HCC 患者的血清样本中的外泌体,运用蛋白质组学技术从中筛选能够准确区分 CCA,PSC,及 HCC 的候选生物标记物。Zhang, H., et al. (2018) Serum exosomes mediate delivery of arginase 1 as a novel mechanism for endothelial dysfunctionin diabetes \"\"研究方法:外泌体中的成分包括蛋白质,脂类小分子化合物,而利用基于质谱的蛋白质组学技术,可以鉴定外泌体中的蛋白组成并对蛋白进行定量分析。外泌体蛋白质组学技术服务: \"\"1. 外泌体分离与纯化外泌体具有磷脂双分子膜结构,导致其沉降系数和蛋白质聚集体有着很大的不同,这些易分离的特性使得我们可以通过超速离心的方法对外泌体进行分离和纯化。2. 技术优势:我们拥有 Label free、TMT/iTRAQ 两种技术研究外泌体定量蛋白质组。

  • Label free 的方法无需同位素标记试剂,并且不受样本数量的限制,可鉴定到有和无的差异,但重复性会受到质谱仪器稳定性等因素的影响;
  • TMT/iTRAQ 属于体外标记技术,标记灵敏度高,重复性好,覆盖度高,但受到样本数量的限制(最多标记 10 组样本)。
 \"\"Label Free 非标定量蛋白质组学分析流程\"\"ITRAQ 标记定量蛋白质组学实验流程样本预处理以及保存: \"\"

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