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【蚂蚁淘小课堂】2015年度创新医疗产品,囊括CRISPR、CTC、NGS……

作者: 时间:2024-11-10 点击量:

年关将至,各大生物圈门户网都开启了盘点大风潮。毫无疑问,2015年里的热门词汇基因编辑、免疫治疗、基因测序……肯定会出现在各类大榜单中。

日前,The scientist推出2015年度生物十大创新产品排行榜。榜单中,除了Illumina、Thermo Fisher、PerkinElmer、Promega等行业老牌企业,也入围了以10X Genomics为首的新起之秀。此外,今年最为火热的生物技术CRISPR也在十大创新产品中占得两席,基于NGS的基因测序平台也入选3款。可见对于生命科学而言,2015年无疑是创新突破硕果累累的一年。NO.1 GemCode Platform(GemCode测序平台) \"公司:10X Genomics(2012年创立,总部位于美国加利福尼亚州普莱森顿)上市/推出时间:2015年2月产品介绍:GemCode平台配备一套分子条形码和分析系统,由芯片、凝胶珠、文库反应液试剂盒和信息学软件组成,外形与台式PCR仪类似。该系统的工作流程:首先将DNA样本加入GemCode芯片,并加入凝胶珠和分液油。在仪器的微流体系统内,分液油将样本分配成100bp大小,并融入带有特定引物标记的凝胶珠中(与Illumina测序兼容)。随后,这些凝胶珠溶解释放引物,启动文库构建。然后,GemCode信息学软件能够将分开的短读取连接起来,产生新的数据类型:连接读取(linked reads)。通过这种方式,研究人员利用GemCode平台和原先的Illumina测序仪,就能获得长片段的信息。而且,连接读取数据能够检测单体型和结构变异(缺失、重复等),以25倍的覆盖率实现全基因组测序,从而更准确地获取基因组信息。技术突破:GemCode平台优势在于能够准确读出结构变异、单倍体型和长片段基因,适用于靶向、外显子组和全基因组测序。通过与短读取的测序仪结合使用,满足现阶段测序要求。目前,它可以与Illumina公司的测序仪兼容。售价:7500美元。耗材成本约500美元/样本。NO.2 MiSeq FGx Forensic Genomics System (第一台适用于法医基因组的NGS系统) \"公司:Illumina上市/推出时间:2015年1月产品介绍:MiSeq FGx法医基因组学系统是第一台为法医基因组学应用而设计、经过充分验证的测序系统。该系统建立在二代测序技术基础之上,一改传统上使用低分辨率的毛细管电泳测序的方法,给法医实验室带来了高分辨率的基因测序革新。MiSeq FGx匹配有特定的设备体系,包括定制的控制软件和分析软件、专用的法医文库构建试剂盒。系统的DNA引物设计可超过200个位点,包括多个短串联重复序列(STR)标记(常用于法医分析),还包括一些SNP(涵盖了表现性状和遗传学性状)。通过边测序边合成 (SBS) 技术实现高度准确的逐个碱基测序。技术优势:MiSeq FGx仪器可以完成复杂的亲缘鉴定,可以处理高度衰退的DNA样本或者混合样本。该仪器提供了前所未有的机会去挖掘很难用传统方法发现的证据。 NO.3 Ion S5 & Ion S5 XL (两款NGS测序仪) \"公司:Thermo Fisher Scientific上市/推出时间:2015年9月产品介绍:Ion S5 、Ion S5 XL两款测序系统基于Ion Torrent技术(2007年由Rothberg创立),可在24小时时间内完成从DNA到数据的完整靶向测序流程。Ion S5和 Ion S5 XL系统将能将多个gene panel和小的基因组结合起来,在一个平台上自定义不同的检测样本。该平台的设计理念是\"即插即用”,例如墨盒式的加样简化了测序前的设置流程,加样、建库、模板制备等手动时间仅需45分钟技术优势:Ion S5 & S5XL有着简捷、灵活、款速、低样本输入量、数据分析存储简易5大特点,可用于癌症、遗传病、非整倍体筛查、感染性疾病等研究领域。系统采用了Ion AmpliSeq技术, 能够处理少量的或低质的样品,仅需10ng的DNA或RNA即可进行测序。售价:Ion S5售价65000美元,S5 XL因为配备有内部硬件和外部服务器,允许更快的处理和连续运行,所以售价150000美元。 NO.4 On Demand Deletions in Human Hap1 Cells (CRISPR基因编辑细胞株)\"公司:Horizon Discovery上市/推出时间:2015年5月产品介绍:On Demand Deletions人Hap1细胞珠基于CRISPR技术实现对特定基因组的删除。Hap1是一种类似于成纤维细胞的永生细胞株,其接近于单倍体,绝大部分染色体是由一个拷贝。去年,Haplogen(现属于Horizon公司)凭借人类基因敲除细胞珠荣登2014年度十大创新技术榜单,能够插入或敲除以改变人类基因组的编码区。今年5月推出的细胞珠可以更大长度的敲除基因。技术优势:利用\"魔剪”技术,可以对基因组进行特定修饰,且12周内就能够获得编辑后的细胞。售价:3400美元/细胞株。 NO. 5 NanoLuc Binary Interaction Technology (验证蛋白互作的双荧光素酶检测试剂盒)\"公司:Promega上市/推出时间:2015年2月产品介绍:蛋白互作是了解细胞生理学最重要的一步骤,特别是研究药物如何在细胞中响应。NanoBiT双荧光素酶检测试剂盒含有两个荧光素酶(18 kDa和1 kDa多肽),能够定量分析蛋白互作,且灵敏度增强。技术优势:与同类试剂盒相比,NanoBiT可以检测表达量低的蛋白互作,并对其定量分析,且能够应用于难以转染的细胞类型。该技术不再要求蛋白质的高峰值,是对先前技术的革新,故而应用前景广。售价:约1000美元。 NO.6 CRISPR Epigenetic Activator (CRISPR表观遗传催化剂)\"公司:Sigma Aldrich上市/推出时间:2015年9月产品介绍:Sigma Aldrich公司首席科学家Qingzhou Ji带领的研究团队对CRISPR技术的运用从编辑基因拓展到编辑表观遗传学水平。CRISPR表观遗传催化剂通过乙酰化特定的组蛋白,激活目标基因,实现不改变DNA序列的前提下对基因组进行修饰。Ji将表观遗传催化剂比喻为进入房间的钥匙:我们想知道房间里面发生了什么,但是并不想打乱整个房间的布置,我们只是想打开门走进去。售价:995美元 NO.7 Phenoptics (应用于免疫疗法的定量病理学成像系统)\"公司:PerkinElmer产品介绍: Phenoptics系统由加州大学Paul Tumeh研究团队与PerkinElmer公司的科学家们耗时三年合作研发出来。作为一种新系统,Phenoptics可以定量分析甲醛固定的组织的原位免疫细胞,通过与计算机相连,实现时空图像可视化,从而获得抗PD-1抗体治疗黑色素瘤之前和期间患者体内免疫细胞密度、位置、附近细胞类型等相关数据。研究团队的相关成果发表于2014年11月版的自然期刊(Nature)。Phenoptics系统包括染色试剂盒、成像系统以及分析软件。结合先进的染色方法、多光谱成像系统、图像分析软件,Phenoptics系统虽处于初阶段,但是将广泛应用于免疫肿瘤学临床应用。技术优势:Phenoptics系统为研究人员提供可视化的免疫细胞和肿瘤细胞互作分析,可以解决单一组织切片中多个生物标志物,让临床医生、科研人员更深入获取癌症机制、免疫疗法等信息。售价:预估140000美元到350000美元。

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