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Lexogen公司SPLIT RNA提取试剂盒 — 为高要求的下游应用如RNA测序特别设计!

作者: 时间:2024-11-10 点击量:

Lexogen公司SPLIT RNA提取试剂盒 — 为高要求的下游应用如RNA测序特别设计!

SPLIT RNA Extraction Kit
       Lexogen公司的SPLIT RNA Extraction Kit是为高要求的下游应用,如RNA测序特别设计的RNA提取试剂盒。使用此试剂盒可以快速高效的提取出无基因组DNA (gDNA)污染的RNA。更重要的,SPLIT试剂盒无需DNase处理(DNase可能会对RNA造成损害)。SPLIT RNA Extraction Kit可以回收总RNA或将总RNA分割成或大或小的RNA组分。
工作流程        SPLIT试剂盒可以简单、快捷、可靠的从不同生物体(如哺乳动物、植物、昆虫、真菌和细菌)的多种材料(血浆、组织、细胞系)中提取RNA。细胞或组织在高盐状态下匀浆,既可使RNase失活,又能提高RNA的溶解性。抽提RNA,并辅以锁相(phase-lock)凝胶管,将含RNA的水相与含DNA和蛋白质的有机中间相清晰的分离开来。RNA组分用硅胶柱纯化法提纯,既可回收总RNA,又可回收大小各异的RNA片段。
优势:
§ 从 <17 nt 到 >10,000 nt的总RNA
§ 可以选择性的将RNA分割成大小各异的RNA组分 (界限大约在150 nt)
§ 仅需要30分钟的便捷的、普遍适用的操作方案
§ 很高的RNA完整性和纯度 (组织的RIN>8,细胞培养则高达RIN 10)
§ RNA中无基因组DNA,且无需DNase处理
§ 高产率 (>100 μg的柱容量)
§ 极佳的提取效率(低投入量,低达0.5mg组织或100个cells)
图 1 | SPLIT试剂盒工作流程的原理概述
性能:        用SPLIT试剂盒提取的样本适用于转录组测序的所有RNA大小范围,从miRNAs到长度大于10,000 nt的mRNAs。提取出的RNA样本不含基因组DNA污染,也不存在通常由DNase处理、热失活或gDNA清除柱引起的RNA降解或大小偏差 (图 2)        使用小RNA分子量标准的spike-in实验证明, SPLIT试剂盒可以从总RNA或小RNA组分中有效的回收大小仅17 nt的siRNA和miRNA(图 3)。
图 2 | SPLIT操作方案提取出的RNA不含基因组DNA污染. (A) 从小鼠肝脏提取的RNA在变性甲醛琼脂糖凝胶上的电泳结果。TRIzol法提取的对照样本里混有明显的基因组DNA,而SPLIT试剂盒提取的RNA中不含基因组DNA。(B) 使用不同的基因组DNA清除方法去除基因组DNA后,用Agilents TapeStation评估RNA分子量标准的完整性(200 - 10,000 nt) — SPLIT在RNA完整性和无偏差大小分布方面,比其它方法有更好的表现。
图3|与miRNA和siRNA大小近似的 RNA在总RNA洗脱过程中或从小RNA组分中得以有效的回收。使用SPLIT试剂盒从小鼠肝脏组织中提取RNA,在提取的RNA中加入单链miRNA和双链siRNA分子量标准,经变性聚丙烯酰胺凝胶电泳。理论上最大的spike-in RNA回收量分别在第1和第5泳道,可用于半定量对照。

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SPLIT RNA Extraction Kit 48 preps 008.48 4,850
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