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德国ChromoTek公司GFP trap和booster实验操作说明!苏州蚂蚁淘生物,优势代理!_技术资料_蚂蚁淘生物-试剂-抗体-蛋白-抑制剂专业代理商! -

作者: 时间:2025-01-30 点击量:

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德国ChromoTek公司GFP trap和booster实验操作说明!苏州蚂蚁淘生物,优势代理!

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使用GFP-Trap _A,GFP融合蛋白如何进行免疫沉淀实验:

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收集细胞:以下以一个免疫沉淀反应使用~106-107的哺乳动物细胞(约一个10厘米培养皿)表达绿色荧光蛋白标记蛋白为例。收获贴壁细胞、吸出生长培养基、向培养皿中加入1毫升预冷的PBS,并刮取细胞。细胞转移到一个预冷却的管子,在500g+4 C时的离心3分钟并丢弃上清液。用冰的PBS洗两次轻轻重新悬浮细胞块的细胞团。洗涤后进入下一步:

Lysecells:(细胞裂解)

1、用移液器或使用注射器在200 l冰冷的裂解缓冲液重悬细胞颗粒。注意:在裂解缓冲液中加入蛋白酶抑制剂与1mMPMSF(用户自备)。对于核/染色质蛋白可采用以下方案:使用RIPA中加入1mg/mlDNase,2.5mMMgCl2(自备).

2、每充分吹打10分钟,把管子放置在冰上30分钟。

3、细胞裂解液20.000xg+4 C离心10分钟。转移裂解产物到一个预冷管中。向裂解液中加入稀释缓冲液300ul。丢弃颗粒。

注意:此时细胞裂解液可以放在-80 C进行长期储存。

可选:向稀释缓冲中加入蛋白酶抑制剂与1mMPMSF(用户自备)。

Equilibratebeads(平衡beads)

4、振荡混匀GFP-Trap _Abeads,吸取25 lbead到500 l冰冷的稀释缓冲液中。离心2.500xg2分钟+4 C。丢弃上清液和重复洗2次。

Bindproteins(结合蛋白)

5.将步骤3得到的稀释的裂解液加入到步骤4得到的平衡的GFP-Trap _Abeads中。如果需要,保存50ul的稀释裂解液进行免疫印迹分析。4 C翻滚振荡1小时。

6.2.500xg+4 C离心2分钟。如果需要,保存50ul上清液进行免疫印迹分析。丢弃其余的上清液。

Washbeads(清洗beads)

7.在500 l冰冷稀释缓冲液中重悬GFP-Trap _Abeads。在2.500xg+4 C离心2分钟。丢弃上清液和重复洗2次。

optional:Increasesaltconcentrationinthesecondwashingstepupto500mM.

可选:在第二次洗的步骤中增加盐的浓度到500mM。

Eluteproteins(洗脱蛋白)

方案一:用于westernblot(所有含GFP荧光标记的重组蛋白都会进行本步定量和鉴定实验)

8.在100 l2xSDS-samplebuffer中重悬GFP-Trap _Abeads。

9.煮沸重悬的GFP-Trap _Abeads在95 C,10min条件下,把免疫复合物从绿色荧光蛋白中游离出来。GFP-Trap _Abeads能通过2.500xg在4 C离心2分钟进行收集,收集的产物上清液可以进行SDS PAGE。

方案二:用于westernblot(所有含GFP荧光标记的重组蛋白都会进行本步定量和鉴定实验)

10.替代步骤8和9的可选步骤:洗脱绑定的蛋白加入50 l0.2M甘氨酸pH值2.5(孵育时间:30秒,恒定混匀),随后离心。转移上清液到新管中,为了中和添加5 l1MTris(pH值10.4)。为了提高洗脱效率可以重复这一步。

方案三:如需进行检测GFP-融合酶的活性检测,无需洗脱单独,可以直接检测。

方案四:如要进行CHIP实验,主要用于含有GFP荧光的重组蛋白的蛋白质/DNA相互作用的实验。染色质免疫沉淀技术一般包括细胞固定,染色质断裂,染色质免疫沉淀,交联反应的逆转,DNA的纯化,以及DNA的鉴定。其中第一步细胞固定,染色质断裂不变,染色质免疫沉淀,则直接进入说明书的第5步,加入的是DNA-蛋白复合物,结合到GFP-Trap _Abeads。进入第6步,第7步,分离得到复合物;进入第10步,得到洗脱的复合物;后期交联反应的逆转,DNA的纯化,以及DNA的鉴定;同普通的CHIP实验。

方案五:pulldown实验:体外检测蛋白质与蛋白质之间相互作用。用于验证两个已知蛋白的相互作用,或者筛选与已知蛋白相互作用的未知蛋白。两个已知蛋白的相互作用:一个蛋白是GFP融合蛋白,另一个蛋白为FLAG标签的融合蛋白;在第5步,同时加入两者,其他步骤不变。进入第10步,得到洗脱的复合物;同时进行GFP和FLAG的westernblot实验。筛选与已知蛋白相互作用的未知蛋白:操作同免疫沉淀法,第10步,得到洗脱的复合物,然后进行后期质谱检测。

方案五:Co-IP实验:体外检测蛋白质与蛋白质之间相互作用。当细胞在非变性条件下被裂解时,完整细胞内存在的许多蛋白质-蛋白质间的相互作用被保留了下来。用于验证两个已知蛋白的相互作用,或者筛选与已知蛋白相互作用的未知蛋白。采用免疫沉淀,对象蛋白为GFP-目的蛋白结合的融合蛋白,与之相结合的蛋白质Y也被沉淀下来,从而达到吸附蛋白质-蛋白质复合物的目的。沉淀下来的蛋白质复合物采用SDS-Page跑胶,westernblot进行鉴定,也可以选择用得到的样品利用质谱进行后续分析。

GFPBooster实验操作:

1.固定:接种于盖玻片的细胞用的3.7%甲醛(溶于PBS)固定,室温下10分钟。

2.用含有0.1%吐温20的PBS(PBST)清洗样品三次。

3.穿透:添加含0.5%的TritonX100(PBS)到样品并温育5分钟,室温下。或者通透细胞:在100%甲醇中温育样品5分钟(--20 C)。

4.用PBST清洗样品两次。

5.封闭:PBST中添加4%BSA加入到样品中,室温温育10分钟。

6.GFP-Booster温育:在blocking缓冲液中加入200倍稀释的GFP-Booster,室温温育1小时。

7.用PBST清洗样品三次,每次洗5-10min。8.如果需要的话,用DNA荧光染料染色(如DAPI)。

9.安装:在水中快速冲洗样品,以防止盐晶体的形成。按照盖玻片。经荧光抗体染色的标本,需要在荧光显微镜下观察。最好在染色当天即作镜检,以防荧光消退,影响结果。

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