套件 Premium RRBS (96 rxns) 已被升级版本取代:Premium RRBS v2 ( 96 次反应)。请注意,适配器不包含在套件中,必须单独购买。更多信息信息请查看:Premium RRBS v2 (96 rxns)。
特征卓越的覆盖率 - 400 万 CpGs 高通量 - 在一次实验中处理 96 个样本经济高效 - 多路复用多达 6 个样本/测序泳道已通过 FFPE、癌症、和低输入样本高效率和最小偏差 - 低 DNA 降解和减少扩增完整试剂盒 - 亚硫酸氢盐转化试剂,MspI 酶,包括条形码的文库制备试剂和掺入对照已经在各种物种 - 人类,小鼠,大鼠,猪,牛上进行了测试、狗、斑马鱼、水溞和更多丽鱼科鱼 (Astatotilapia calliptera)、苔藓青蛙、黄腹滑块、骰子蛇、斑胸草雀、洪堡企鹅、叶鸟、秃鹰、秃鹫珍珠鸡、帕尔马袋鼠、猎豹、欧洲盘羊
Superiorcoverage
比较竞争技术之间的 CpG 覆盖率。
他们喜欢它!新的 Diagenode Premium RRBS 试剂盒使用早期样本池和多重测序,可以轻松经济高效地使用 RRBS 并实现高通量。最重要的是,该方法为人类基因组提供了高达 400 万个 CpG 的改进覆盖率。我们成功地将此协议用于 1,000 多个样本,包括六个不同物种、各种癌症、FFPE 和低输入样本。 Paul Datlinger 和 Christoph Bock,奥地利科学院 CeMM 分子医学研究中心,奥地利维也纳
准确DNA 甲基化水平的测定
使用 Diagenode 的 Premium RRBS 试剂盒获得了出色的结果:几乎 90% 的对齐率,覆盖了 410 万个 CpG,亚硫酸氢盐转化率约为 9所有样品为 9.5%。使用 Diagenode 的 Premium RRBS 试剂盒获得的 IGF2 区域的 DNA 甲基化百分比。分析了两种人类细胞系:Gm12878 和 MCF7。 MCF7 细胞系一式两份研究。每个峰代表一个 CpG 处的 DNA 甲基化百分比。甲基化的 CpG 以红色显示,未甲基化的 CpG 以灰色显示。它是如何工作的
通过使用限制酶切割基因组MspI(CCGG 目标位点)后进行大小选择,DNA 被富集以代表富含 CpG 的基因组区域(包括 CpG 岛、CpG 岛岸、增强子和其他基因调控元件),这些区域与表观遗传调控特别相关。类似于用于突变发现的外显子组测序,RRBS 协议丰富了一些最有趣的目标区域和其他与全基因组亚硫酸氢盐测序相比,eby 的测序成本降低了 10-20 倍。Premium RRBS KitIllumina® RRBS protocolDNA input100 ng2-5 µgMultiplexingPooling of 6 samples (one HiSeq lane)no guidelinesBisulfite conversionOne bisulfite reaction per pool (6 samples) )每个样品一次亚硫酸氢盐反应# 纯化步骤27主要特征低输入 - 成本效益 - 针对高通量进行了优化 - 完整的试剂盒高输入 - 未针对高通量进行优化 - 来自不同供应商的试剂 自然方法自然方法
Premium RRBS 技术:经济高效的 DNA 甲基化映射,具有出色的覆盖率Christoph Bock2, Sharon Squazzo3, Miklos Laczik1, Paul Datlinger2, Anne-Clémence Veillard1, Nature Methods 13 (2016) 2016 年 1 月 28 日在线发布 查看自然方法论文 新的 Diagenode Premium RRBS 套件使 RRBS 的使用变得容易成本-有效且具有高throughput,使用早期样本池和多重测序。最重要的是,该方法为人类基因组提供了高达 400 万个 CpG 的改进覆盖率。我们成功地将此方案用于 1,000 多个样本,包括六种不同的物种、各种癌症、FFPE 和低输入样本。 我们的实验室已将 Diagenode 的 RRBS 服务用于小鼠和人类样本。该服务在每个阶段都无可挑剔,从样品制备到生物信息学分析,因为它始终以客户为导向。我强烈推荐我的同事使用 Diagenode 的 RRBS 服务。 使用 Premium RRBS 试剂盒,我们在我们的实验室中快速建立了 RRBS 文库制备团体。诊断enode 在湿实验室事务和生物信息学方面的支持非常以客户为导向且密切相关,加速了该方法的建立。 我们的实验室在大鼠脑样本上使用了 Diagenode 的 Premium RRBS 试剂盒。该协议易于理解、合乎逻辑、编写良好且易于遵循。这是一个复杂但巧妙的工具包。我发现我可以向公司提问真是太棒了,他们的回答真的很有用。我们能够构建一个文库,并在 BioAnalyzer 上运行,结果看起来非常好,可以进行测序了。我肯定会推荐我的同事使用 Diagenode 的 Premium RRBS 套件。 Diagenode 强烈推荐使用这个:Premium RRBS kit (96 rxns) - 由 Premium RRBS v2 x96 C02030037 (Diagenode Cat# C02030033) 取代。点击这里复制到剪贴板。 在您的出版物中使用我们的产品?让我们知道! 草甘膦和农达除草剂的比较毒物基因组学,基于哺乳动物干细胞的基因毒性测定和 Sprague-Dawley 大鼠的分子分析. Mesnage R. 等人。基于草甘膦的除草剂 (GBH) 是否比单独使用草甘膦更有效地激活驱动致癌作用的细胞机制仍然存在争议。由于 GBH 比草甘膦更具细胞毒性,我们推断它们也可能更能激活致癌途径。我们通过……对这一假设进行了检验... 对伤害感受性和神经性慢性疼痛亚型患者进行的全基因组表观基因组分析揭示了参与神经肌肉骨骼系统的基因甲基化的改变 Stenz 等人伤害感受性疼痛涉及激活伤害感受器不会损害神经系统,而神经性疼痛与中枢或周围神经系统的改变有关。慢性疼痛本身d 从急性疼痛到慢性疼痛的转变可能受到表观遗传控制。在此横断面研究中... 环境富集在老年小鼠海马体中保留了年轻的 DNA 甲基化景观 Sara Zocher、Rupert W. Overall、Mathias Lesche、Andreas Dahl 和 Gerd Kempermann衰老与表观遗传变化有关,包括 DNA 甲基化。生活方式干预可以改善衰老过程中的大脑功能,但它们对与年龄相关的表观遗传变化的影响尚不清楚。使用全基因组 DNA 甲基化测序,我们在此表明,对患有左旋多巴诱导的运动障碍的大鼠进行利鲁唑给药会导致神经元基因中 DNA 甲基化的丧失 Luca Pagliaroli、Abel Fothi、Ester Nespoli、 Istvan Liko、Borbala Veto、Piroska Devay、Flora Szeri、Bastian Hengerer、Csaba Barta、Tamas Aranyi 运动障碍的特征是由于神经元活动功能障碍导致的异常重复性不自主运动。虽然我evodopa 引起的运动障碍,以抽动样异常不自主运动为特征,对帕金森病患者没有临床治疗方法,动物研究表明 Riluzole,w... 肠-肝轴的多组学表型分析揭示了大鼠低剂量杀虫剂混合物的代谢扰动。 Mesnage, Robin 等人。使用当前的一系列监管毒性测试并不总能准确检测到农药对健康的影响。我们比较了标准组织病理学和血清生化措施以及多组学分析,对食品中经常检测到的六种农药的混合物进行亚慢性毒性试验(偶氮菊酯... 杀虫剂氯菊酯诱导与转录组学和转录组学相关的跨代行为变化斑马鱼 (Daniorerio) 的表观遗传改变。Blanc、Mélanie 等人。拟除虫菊酯杀虫剂氯菊酯广泛用于农业和家庭用途。以前的数据表明它作为一种发育性神经毒性物质ant 并且可以在非目标生物体中诱导跨代效应。然而,相关的潜在机制仍不清楚。本研究的目的是... Gadd45b 的持续过表达扰乱 DNA 甲基化诱导小鼠染色质解体、DNA 链断裂和多巴胺能神经元死亡 Ravel-Godreuil, C. 等人。异染色质解体是衰老和 DNA 甲基化状态的一个关键标志是目前实足年龄的主要分子预测因子。帕金森病和阿尔茨海默病等最常见的神经退行性疾病与年龄有关,但衰老过程和染色质改变如何影响... 新型岩藻糖苷病相关突变的鉴定:一个 5 年的案例-有两个额外的罕见染色体畸变和受影响的 DNA 甲基化模式的老波兰女孩。 Domin A. 等人。岩藻糖苷贮积症是一种罕见的神经退行性常染色体隐性遗传病,表现为进行性神经和精神疾病。退化、生长迟缓、皮肤和骨骼异常、智力障碍和面部特征粗糙。它是由雄性小鼠在围产期和慢性 BPS 暴露后编码 α-... 的双等位基因突变引起的。 肝脏转录组和 DNA 甲基化模式。布鲁波特A.等。背景:双酚 S (BPS) 是一种常见的双酚 A (BPA) 替代品,因为 BPA 实际上在世界范围内被禁止。但是,BPS 和 BPA 都具有内分泌干扰特性。它们的影响主要出现在围产期暴露后的成年期。本研究的目的是调查...... 糖代谢性状、脂肪组织 DNA 甲基化和基因表达的综合分析确定了非洲裔美国人胰岛素抵抗和肥胖的表观遗传调控机制 Neeraj K. Sharma、Mary E. Comeau、Dennis Montoya、Matteo Pellegrini、Timothy D. Howard、Carl D. Langefeld、Swapan K. Das 胰岛素敏感性下降由脂肪组织 (AT) 功能障碍引起的 ty 是 2 型糖尿病中最早的致病事件之一。我们假设差异 DNA 甲基化 (DNAm) 通过调节 AT 中的转录物表达来控制胰岛素敏感性和肥胖。将 AT DNAm 图谱与转录物整合... 连续胶质母细胞瘤标本中的 DNA CpG 甲基化。 Kraboth、Z 和 Galik、B 和 Tompa、M 和 Kajtar、B 和 Urban、P 和 Gyenesei、A 和 Miseta、A 和 Kalman,BP 目的:胶质母细胞瘤是最具侵袭性的脑肿瘤。更好地了解导致其进化的分子机制对于开发比可用方式更有效的治疗方法至关重要。在这里,我们的目标是确定胶质母细胞瘤发展和复发的分子驱动因素... 生命早期暴露于环境相关水平的内分泌干扰物驱动鱼类模型中的多代和跨代表观遗传变化 Major Kaley M., DeCourten Bethany M.,李杰,英国人ton Monica, Settles Matthew L., Mehinto Alvine C., Connon Richard E., Brander Susanne M.The inland silverside, Menidia beryllina, 是一种广盐鱼和生态毒理学中的模型生物。我们之前表明,暴露于皮摩尔 (ng/L) 水平的内分泌干扰化学物质 (EDC) 会对 M. beryllina 产生各种影响,从基因表达的变化到表型改变。这里... 慢性大麻二酚改变成年小鼠海马体的全基因组 DNA 甲基化:对精神疾病的表观遗传学意义。 Wanner NM、Colwell M、Drown C、Faulk CCannabidiol (CBD) 是在大麻(Cannabis sativa)中发现的主要非精神活性化合物,并且由于含 CBD 的产品广泛供应而成为越来越受欢迎的膳食补充剂。 CBD 经 FDA 批准用于治疗癫痫,并表现出抗焦虑、抗精神病、亲社会等作用。 Dnmt3a 和 Dnmt3b-退役的胎儿增强剂与肾脏疾病有关 Guan Y, Liu H、Ma Z、Li SY、Park J、Sheng X、Susztak 背景知识:胞嘧啶甲基化是一种表观遗传标记,它决定细胞命运和对刺激的反应。肾脏发育过程中甲基化逻辑的时间和建立仍然未知。 DNA 甲基转移酶 3a 和 3b 是能够建立甲基化的酶。方Flåm Siri T.、Mæhlen Marthe T.、Mjaavatten Maria D.、Lillegraven Siri、Aga Anna-Birgitte、Evenrød Ida M.、Norli Ellen S.、Andreassen Bettina K.、Franzenburg Sören、Franke Andre、Haavardsholm Espen A.、Rayner Simon, Gervin Kris 类风湿性关节炎 (RA) 是一种慢性自身免疫性疾病,会导致身体多个关节疼痛和肿胀。潜在的疾病机制被认为涉及普通基因之间复杂的相互作用etic 和环境因素。据估计,抗瓜氨酸类风湿性关节炎的遗传力约为 50%... 双酚 S 的致肥胖作用改变了雄性小鼠肝脏中的 mRNA 表达和 DNA 甲基化谱 Brulport Axelle, Vaiman Daniel, Chagnon Marie -Christine, Le Corre Ludovic 环境污染越来越被认为是影响肥胖发病率的一个重要因素。内分泌干扰物 (ED) 是 DOHaD(健康和疾病的发育起源)概念中的重要参与者,其中表观遗传机制起着至关重要的作用。双酚 A (BPA) 是人体中使用的一种单体... 线粒体应激通过核 DNA 的表观遗传修饰触发促生存反应。 Mayorga L、Salassa BN、Marzese DM、Loos MA、Eiroa HD、Lubieniecki F、García Samartino C、Romano PS、Roqué M 线粒体功能障碍是一种重要的细胞应激源,当强烈而持久的细胞必须释放适应性反应以防止其灭绝时。进一步此外,线粒体可以诱导核转录变化,DNA 甲基化可以调节细胞对压力的反应。我们假设 ... 钾通道 KCa3.1 和免疫信号通路的差异 DNA 甲基化与 BCG 疫苗接种后的婴儿免疫反应相关。 Hasso-Agopsowicz M、Scriba TJ、Hanekom WA、Dockrell HM、Smith SGBacillus Calmette-Guérin (BCG) 是唯一获得许可的结核病 (TB) 疫苗,并在不同国家/地区对肺部疾病产生高度可变的保护作用。我们假设 DNA 甲基化是驱动 BCG 诱导的免疫反应变异性的分子机制之一。 DNA 甲基化... 原位固定重新定义骨骼肌干细胞的静止和早期激活捕捉他们的体内状态。然而,大多数细胞分离方案涉及冗长的机械和酶促解离步骤,然后进行流式细胞术,使细胞暴露于压力... DNMT3B 过表达导致 T-ALL 和伯基特淋巴瘤 Poole 等人的异常 DNA 甲基化和 MYC 驱动的肿瘤维持。异常的 DNA 甲基化是癌症的标志。然而,我们对肿瘤细胞特异性 DNA 甲基化模式如何建立和维持的了解有限。在这里,我们报道了在 T 细胞急性淋巴细胞白血病 (T-ALL) 和伯基特淋巴瘤中,MYC 致癌基因导致 DNA 过度表达... DNA 甲基化和酒精使用障碍:进展和挑战 Zhang H . 和 Gelernter J. 背景和目标酒精使用障碍 (AUD) 的风险受基因-环境相互作用的影响。环境因素可以通过 DNA 甲基化等表观遗传机制影响基因表达。本综述概述了有关 DNA 甲基化和 AUD 关联的发现.... Diagenode® Premium RRBS 技术:具有高覆盖率的经济高效的 DNA 甲基化作图 Anne-Clémence Veillard、Paul Datlinger、Miklos Laczik、Sharon Squazzo 和 Christoph Bock 减少代表性的亚硫酸氢盐测序 (RRBS) 可以在任何脊椎动物物种中进行基因组规模的 DNA 甲基化分析。该测定受益于亚硫酸氢盐测序的实际优势,同时避免了全基因组测序的成本。 Diagenode Premium RRBS 套件使这项技术得到广泛应用... 您即将请求我们的表观基因组学服务报价。请填写下表,我们会尽快与您联系。 All * fields are mandatory 覆盖范围更广 他们喜欢它!小>新迪agenode Premium RRBS Kit 使用早期样本池和多重测序,可以轻松经济高效地使用 RRBS 并实现高通量。最重要的是,该方法为人类基因组提供了高达 400 万个 CpG 的改进覆盖率。我们成功地将此协议用于 1,000 多个样本,包括六个不同物种、各种癌症、FFPE 和低输入样本。 Paul Datlinger 和 Christoph Bock,奥地利科学院 CeMM 分子医学研究中心,奥地利维也纳 准确测定 DNA 甲基化水平 工作原理通过使用限制性内切酶 MspI(CCGG 靶位点)切割基因组,然后选择大小,富集 DNA 以代表富含 CpG 的基因组区域(包括 CpG 岛) 、CpG 岛岸、增强子和其他基因调控元件),它们与表观遗传调控特别相关。类似于用于突变发现的外显子组测序,RRBS 协议丰富了一些最有趣的目标区域,从而实现了减少与全基因组亚硫酸氢盐测序相比,测序成本是其 10-20 倍。
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Illumina® RRBS 协议
DNA 输入 100 ng 2-5 µ g 多路复用 6个样本的汇集(一个HiSeq泳道) 无指南 亚硫酸氢盐转化 每个池一个亚硫酸氢盐反应(6 个样品) 每个样品一个亚硫酸氢盐反应 #纯化步骤 2 7 主要特性 低投入 - 高性价比 - 针对高通量优化 - 完整套件 高输入 - 未针对高通量进行优化 - 来自不同供应商的试剂
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