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高级 RRBS 套件 |成岩节点 Diagenode

作者: 时间:2024-12-15 点击量:

Diagenode.comBisulfite conversionPremium RRBS kit (96 rxns) - 替换为 Premium RRBS v2 x96 C02030037 Premium RRBS kit (96 rxns) - 替换为 Premium RRBS v2 x96 C02030037\"甲基化工具包图标\"\"Methylation×\"\"描述文件相关目录编号格式PriceC0203003396 rxnsOther formatC0203003224 rxnsDISCONTINUED

套件 Premium RRBS (96 rxns) 已被升级版本取代:Premium RRBS v2 ( 96 次反应)。请注意,适配器不包含在套件中,必须单独购买。更多信息信息请查看:Premium RRBS v2 (96 rxns)。

特征卓越的覆盖率 - 400 万 CpGs 高通量 - 在一次实验中处理 96 个样本经济高效 - 多路复用多达 6 个样本/测序泳道已通过 FFPE、癌症、和低输入样本高效率和最小偏差 - 低 DNA 降解和减少扩增完整试剂盒 - 亚硫酸氢盐转化试剂,MspI 酶,包括条形码的文库制备试剂和掺入对照已经在各种物种 - 人类,小鼠,大鼠,猪,牛上进行了测试、狗、斑马鱼、水溞和更多丽鱼科鱼 (Astatotilapia calliptera)、苔藓青蛙、黄腹滑块、骰子蛇、斑胸草雀、洪堡企鹅、叶鸟、秃鹰、秃鹫珍珠鸡、帕尔马袋鼠、猎豹、欧洲盘羊

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Superiorcoverage

比较竞争技术之间的 CpG 覆盖率。

他们喜欢它!新的 Diagenode Premium RRBS 试剂盒使用早期样本池和多重测序,可以轻松经济高效地使用 RRBS 并实现高通量。最重要的是,该方法为人类基因组提供了高达 400 万个 CpG 的改进覆盖率。我们成功地将此协议用于 1,000 多个样本,包括六个不同物种、各种癌症、FFPE 和低输入样本。 Paul Datlinger 和 Christoph Bock,奥地利科学院 CeMM 分子医学研究中心,奥地利维也纳

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准确DNA 甲基化水平的测定

使用 Diagenode 的 Premium RRBS 试剂盒获得了出色的结果:几乎 90% 的对齐率,覆盖了 410 万个 CpG,亚硫酸氢盐转化率约为 9所有样品为 9.5%。使用 Diagenode 的 Premium RRBS 试剂盒获得的 IGF2 区域的 DNA 甲基化百分比。分析了两种人类细胞系:Gm12878 和 MCF7。 MCF7 细胞系一式两份研究。每个峰代表一个 CpG 处的 DNA 甲基化百分比。甲基化的 CpG 以红色显示,未甲基化的 CpG 以灰色显示。

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它是如何工作的

通过使用限制酶切割基因组MspI(CCGG 目标位点)后进行大小选择,DNA 被富集以代表富含 CpG 的基因组区域(包括 CpG 岛、CpG 岛岸、增强子和其他基因调控元件),这些区域与表观遗传调控特别相关。类似于用于突变发现的外显子组测序,RRBS 协议丰富了一些最有趣的目标区域和其他与全基因组亚硫酸氢盐测序相比,e​​by 的测序成本降低了 10-20 倍。Premium RRBS KitIllumina® RRBS protocolDNA input100 ng2-5 µgMultiplexingPooling of 6 samples (one HiSeq lane)no guidelinesBisulfite conversionOne bisulfite reaction per pool (6 samples) )每个样品一次亚硫酸氢盐反应# 纯化步骤27主要特征低输入 - 成本效益 - 针对高通量进行了优化 - 完整的试剂盒高输入 - 未针对高通量进行优化 - 来自不同供应商的试剂 自然方法

自然方法

Premium RRBS 技术:经济高效的 DNA 甲基化映射,具有出色的覆盖率Christoph Bock2, Sharon Squazzo3, Miklos Laczik1, Paul Datlinger2, Anne-Clémence Veillard1,

Nature Methods 13 (2016)

2016 年 1 月 28 日在线发布

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感言

新的 Diagenode Premium RRBS 套件使 RRBS 的使用变得容易成本-有效且具有高throughput,使用早期样本池和多重测序。最重要的是,该方法为人类基因组提供了高达 400 万个 CpG 的改进覆盖率。我们成功地将此方案用于 1,000 多个样本,包括六种不同的物种、各种癌症、FFPE 和低输入样本。

Paul Datlinger 和 Christoph Bock,奥地利科学院 CeMM 分子医学研究中心,奥地利维也纳

我们的实验室已将 Diagenode 的 RRBS 服务用于小鼠和人类样本。该服务在每个阶段都无可挑剔,从样品制备到生物信息学分析,因为它始终以客户为导向。我强烈推荐我的同事使用 Diagenode 的 RRBS 服务。

Prof. Lucia Altucci, MD, PhD, Seconda Università degli Studi di Napoli, Dipartimento di Biochimica, Biofisica e Patologia generale。

使用 Premium RRBS 试剂盒,我们在我们的实验室中快速建立了 RRBS 文库制备团体。诊断enode 在湿实验室事务和生物信息学方面的支持非常以客户为导向且密切相关,加速了该方法的建立。

Dr. Eduard Resch,Fraunhofer Institute for Molecular Biology and Applied Ecology IME, Project Group Translational Medicine & Pharmacology TMP, Frankfurt am Main

我们的实验室在大鼠脑样本上使用了 Diagenode 的 Premium RRBS 试剂盒。该协议易于理解、合乎逻辑、编写良好且易于遵循。这是一个复杂但巧妙的工具包。我发现我可以向公司提问真是太棒了,他们的回答真的很有用。我们能够构建一个文库,并在 BioAnalyzer 上运行,结果看起来非常好,可以进行测序了。我肯定会推荐我的同事使用 Diagenode 的 Premium RRBS 套件。

Borbála Vető,匈牙利布达佩斯酶学研究所DocumentsRRBS Pooling aid EXCEL FILERRBS Pooling aid 下载Diagenode Premium RRBS 技术:经济高效的 DNA 甲基化作图,具有出色的 CpG 分辨率和覆盖率 应用说明 DNA 甲基化是一种重要的表观遗传标记,与发育和疾病具有广泛的相关性。 ... DownloadPremium RRBS kit MANUALDiagenode 的 Premium RRBS technology Positive and negative spike-in controls are... 下载 FASTA 格式的甲基化 spike-in 控制序列 本文档和文件用于处理来自包含... DownloadSequence of the unmethylated spike-in control in FASTA 格式 本文档和文件用于处理来自包含在...本文档和文件用于处理来自包含在...中的尖峰控制的测序数据下载高级 RRBS 尖峰控制 - 数据处理手册本文档和文件用于处理测序数据 f从包含在...中的尖峰控制 下载安全表Premium Reduced Representation Bisulfite Sequencing RRBS Kit SDS GB en DownloadPremium Reduced Representation Bisulfite Sequencing RRBS Kit SDS US en DownloadPremium Reduced Representation Bisulfite Sequencing RRBS Kit SDS DE 下载Premium Reduced Representation Bisulfite Sequencing RRBS Kit SDS JP jaDownloadPremium Reduced Representation Bisulfite Sequencing RRBS Kit SDS BE nlDownloadPremium Reduced Representation Bisulfite Sequencing RRBS Kit SDS BE frDownloadPremium Reduced Representation Bisulfite Sequencing RRBS Kit SDS FR frDownloadPremium Reduced Representation Bisulfite Sequencing RRBS Kit SDS ES esDownloadPublications如何在你的工作中正确引用该产品

Diagenode 强烈推荐使用这个:Premium RRBS kit (96 rxns) - 由 Premium RRBS v2 x96 C02030037 (Diagenode Cat# C02030033) 取代。点击这里复制到剪贴板。

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Dnmt3a 和 Dnmt3b-退役的胎儿增强剂与肾脏疾病有关 Guan Y, Liu H、Ma Z、Li SY、Park J、Sheng X、Susztak 背景知识:胞嘧啶甲基化是一种表观遗传标记,它决定细胞命运和对刺激的反应。肾脏发育过程中甲基化逻辑的时间和建立仍然未知。 DNA 甲基转移酶 3a 和 3b 是能够建立甲基化的酶。方Flåm Siri T.、Mæhlen Marthe T.、Mjaavatten Maria D.、Lillegraven Siri、Aga Anna-Birgitte、Evenrød Ida M.、Norli Ellen S.、Andreassen Bettina K.、Franzenburg Sören、Franke Andre、Haavardsholm Espen A.、Rayner Simon, Gervin Kris 类风湿性关节炎 (RA) 是一种慢性自身免疫性疾病,会导致身体多个关节疼痛和肿胀。潜在的疾病机制被认为涉及普通基因之间复杂的相互作用etic 和环境因素。据估计,抗瓜氨酸类风湿性关节炎的遗传力约为 50%...

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Diagenode® Premium RRBS 技术:具有高覆盖率的经济高效的 DNA 甲基化作图 Anne-Clémence Veillard、Paul Datlinger、Miklos Laczik、Sharon Squazzo 和 Christoph Bock 减少代表性的亚硫酸氢盐测序 (RRBS) 可以在任何脊椎动物物种中进行基因组规模的 DNA 甲基化分析。该测定受益于亚硫酸氢盐测序的实际优势,同时避免了全基因组测序的成本。 Diagenode Premium RRBS 套件使这项技术得到广泛应用...

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\',\'label1\' => \'特征\', \'info1\' => \'
  • 卓越的覆盖范围 – 400万个CpG
  • 高通量 - 在一次实验中处理 96 个样本
  • 具有成本效益 –多路复用多达 6 个样本/测序泳道
  • 已通过 FFPE、癌症和低输入样本验证
  • 高效率和最小偏差 strong> - 低 DNA 降解和减少扩增
  • 完整试剂盒 –亚硫酸氢盐转化试剂、MspI 酶、文库制备试剂(包括条形码)和 spike-in 对照
  • 已经在各种物种上进行了测试–人类、小鼠、大鼠、猪、牛、狗、斑马鱼、水蚤 还有更多 丽鱼科鱼(Astatotilapia calliptera)、苔藓蛙、黄腹水龟、骰子蛇、斑胸草雀、洪堡企鹅、树叶鸟、秃鹰、秃鹰、珍珠鸡、巴马袋鼠、猎豹、欧洲盘羊
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    覆盖范围更广

    p>竞争技术之间的 CpG 覆盖率比较。

    他们喜欢它!小>新迪agenode Premium RRBS Kit 使用早期样本池和多重测序,可以轻松经济高效地使用 RRBS 并实现高通量。最重要的是,该方法为人类基因组提供了高达 400 万个 CpG 的改进覆盖率。我们成功地将此协议用于 1,000 多个样本,包括六个不同物种、各种癌症、FFPE 和低输入样本。 Paul Datlinger 和 Christoph Bock,奥地利科学院 CeMM 分子医学研究中心,奥地利维也纳

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    准确测定 DNA 甲基化水平

    使用 Diagenode 的 Premium RRBS 试剂盒获得了优异的结果:近 90 % 对齐率,覆盖了 410 万个 CpG,所有样品的亚硫酸氢盐转化率约为 99.5%。使用 Diagenode 的 Premium RRBS 试剂盒获得的 IGF2 区域的 DNA 甲基化百分比。分析了两种人类细胞系:Gm12878 和 MCF7。 MCF7 细胞系一式两份研究。每个峰代表一个 CpG 处的 DNA 甲基化百分比。甲基化的 CpG 以红色显示,未甲基化的 CpG 以灰色显示。

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    工作原理通过使用限制性内切酶 MspI(CCGG 靶位点)切割基因组,然后选择大小,富集 DNA 以代表富含 CpG 的基因组区域(包括 CpG 岛) 、CpG 岛岸、增强子和其他基因调控元件),它们与表观遗传调控特别相关。类似于用于突变发现的外显子组测序,RRBS 协议丰富了一些最有趣的目标区域,从而实现了减少与全基因组亚硫酸氢盐测序相比,测序成本是其 10-20 倍。

    高级 RRBS 试剂盒

    Illumina® RRBS 协议
    DNA 输入100 ng2-5 µ g
    多路复用6个样本的汇集(一个HiSeq泳道)无指南
    亚硫酸氢盐转化每个池一个亚硫酸氢盐反应(6 个样品)每个样品一个亚硫酸氢盐反应
    #纯化步骤27
    主要特性低投入 - 高性价比 - 针对高通量优化 - 完整套件高输入 - 未针对高通量进行优化 - 来自不同供应商的试剂
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